296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2287 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2287  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 225 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2611  dethiobiotin synthase  89.64 
 
 		 225 aa  360  1e-98  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2332  dethiobiotin synthase  87.84 
 
 		 225 aa  352  2e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323651  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5169  dethiobiotin synthase  71.1 
 
 		 225 aa  266  1e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456743  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6356  dethiobiotin synthase  70.7 
 
 		 225 aa  262  3e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0738  dethiobiotin synthase  67.86 
 
 		 223 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.232851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0040  dethiobiotin synthase  48.62 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  42.58 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0813  dethiobiotin synthase  41.23 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.448575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1345  dethiobiotin synthase  42.71 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.408659  normal  0.0545266 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1867  dethiobiotin synthase  42.29 
 
 		 223 aa  144  9e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0888  dethiobiotin synthase  34.47 
 
 		 231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2876  dethiobiotin synthase  43.32 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1110  dethiobiotin synthetase  33.98 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.588199  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  35.19 
 
 		 248 aa  104  9e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1300  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  35.56 
 
 		 708 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0734897  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  33.15 
 
 		 212 aa  103  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  33.95 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  37.11 
 
 		 245 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  33.15 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  35.1 
 
 		 247 aa  99  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  31.34 
 
 		 242 aa  98.6  7e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  31.88 
 
 		 242 aa  98.2  8e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  30.92 
 
 		 242 aa  98.2  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  35.75 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  34.78 
 
 		 262 aa  97.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  34.78 
 
 		 251 aa  97.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  31.4 
 
 		 242 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  31.4 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  30.43 
 
 		 242 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  34.83 
 
 		 226 aa  95.9  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  34.09 
 
 		 238 aa  95.5  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  36.87 
 
 		 230 aa  95.1  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  35.21 
 
 		 239 aa  95.1  8e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  35.35 
 
 		 237 aa  95.1  9e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  29.95 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  29.95 
 
 		 242 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  29.95 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  32.96 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  30.96 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  32.96 
 
 		 230 aa  93.6  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  29.95 
 
 		 242 aa  92.8  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  29.46 
 
 		 204 aa  93.2  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  33.01 
 
 		 238 aa  92.8  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  30.96 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  32.4 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  32.4 
 
 		 228 aa  92.4  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  32.78 
 
 		 225 aa  92  7e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  31.84 
 
 		 230 aa  91.3  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  29.47 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  34.42 
 
 		 210 aa  89.7  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  31.84 
 
 		 226 aa  89.7  4e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  33.18 
 
 		 242 aa  88.6  7e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  31.84 
 
 		 225 aa  88.6  7e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  26.72 
 
 		 243 aa  88.2  9e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  32.22 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  32.22 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  32.22 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1583  dethiobiotin synthase  31.47 
 
 		 240 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0552587  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  32.22 
 
 		 225 aa  88.2  1e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  31.84 
 
 		 227 aa  88.2  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  32.22 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  32.22 
 
 		 225 aa  87.8  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  31.84 
 
 		 240 aa  87.8  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  25.24 
 
 		 228 aa  86.7  2e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  31.84 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  31.84 
 
 		 240 aa  87.4  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  32.22 
 
 		 225 aa  87.4  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  32.54 
 
 		 234 aa  87.4  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 220 aa  87  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  34.81 
 
 		 232 aa  86.3  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  31.28 
 
 		 238 aa  85.9  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  31.28 
 
 		 245 aa  85.9  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  35.55 
 
 		 241 aa  85.5  6e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  37.58 
 
 		 235 aa  85.5  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  32.11 
 
 		 236 aa  85.5  6e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  28.49 
 
 		 228 aa  85.1  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  34.56 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  29.67 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  32.22 
 
 		 221 aa  84  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  32.22 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  31.22 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  31.94 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  32.6 
 
 		 228 aa  83.2  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  37.2 
 
 		 235 aa  82.8  0.000000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0246  dethiobiotin synthetase  33.83 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.187676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0422  dethiobiotin synthase  33.83 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000789598 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0071  dethiobiotin synthase  38.81 
 
 		 223 aa  82.8  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.255458  normal  0.0373724 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  35.61 
 
 		 216 aa  82  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  30.73 
 
 		 226 aa  82  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  30.32 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  31.52 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  27.85 
 
 		 242 aa  81.3  0.00000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6277  dithiobiotin synthetase  34.13 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1911  dethiobiotin synthase  32.02 
 
 		 227 aa  81.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  30.48 
 
 		 243 aa  81.3  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  32.02 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2773  dethiobiotin synthase  29.21 
 
 		 226 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0046697  hitchhiker  0.00857242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  28.57 
 
 		 249 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2426  dithiobiotin synthetase  31.63 
 
 		 229 aa  80.5  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>