294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_2332 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_2332  dethiobiotin synthase  100 
 
 		 225 aa  441  1e-123  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.323651  normal  0.923086 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2611  dethiobiotin synthase  96.44 
 
 		 225 aa  401  1e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.033343 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2287  dethiobiotin synthase  87.84 
 
 		 225 aa  351  5e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.448899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5169  dethiobiotin synthase  69.44 
 
 		 225 aa  258  5.0000000000000005e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.456743  normal  0.0700115 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6356  dethiobiotin synthase  68.84 
 
 		 225 aa  256  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0738  dethiobiotin synthase  64.73 
 
 		 223 aa  244  6e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.232851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0040  dethiobiotin synthase  48.62 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0813  dethiobiotin synthase  41.94 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.448575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  43.48 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1867  dethiobiotin synthase  44.22 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1345  dethiobiotin synthase  42.21 
 
 		 221 aa  146  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.408659  normal  0.0545266 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1110  dethiobiotin synthetase  35.32 
 
 		 230 aa  135  7.000000000000001e-31  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.588199  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2876  dethiobiotin synthase  47.06 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0888  dethiobiotin synthase  35.87 
 
 		 231 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  33.71 
 
 		 212 aa  99.4  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1300  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  35.21 
 
 		 708 aa  99  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0734897  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1675  dethiobiotin synthetase  35.91 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1373  dethiobiotin synthase  35.91 
 
 		 262 aa  97.1  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  32.6 
 
 		 212 aa  95.9  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2384  dethiobiotin synthase  34.91 
 
 		 238 aa  95.9  4e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.393597  normal  0.141052 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  32.4 
 
 		 242 aa  95.5  6e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0526  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 248 aa  95.1  7e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  33.52 
 
 		 242 aa  95.1  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0465  dithiobiotin synthetase  32.72 
 
 		 230 aa  94.7  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000224118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2887  dethiobiotin synthase  32.69 
 
 		 226 aa  92  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.5609  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  34.88 
 
 		 245 aa  92  7e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1833  dethiobiotin synthase  34.9 
 
 		 233 aa  91.7  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  34.83 
 
 		 226 aa  91.3  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  31.84 
 
 		 242 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  31.84 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  31.84 
 
 		 242 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  35.35 
 
 		 210 aa  90.5  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  32.4 
 
 		 242 aa  89.7  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0529  dethiobiotin synthase  34.43 
 
 		 237 aa  88.6  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.256581  normal  0.69291 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  33.17 
 
 		 247 aa  88.6  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  33.95 
 
 		 239 aa  88.6  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  34.83 
 
 		 238 aa  88.2  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  31.28 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  31.28 
 
 		 242 aa  87.8  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  31.28 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0801  dithiobiotin synthetase  32.22 
 
 		 225 aa  86.7  2e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  31.84 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2439  dethiobiotin synthase  32.78 
 
 		 227 aa  87  2e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00602737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2864  dethiobiotin synthase  32.22 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000724623  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0892  dithiobiotin synthetase  31.72 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000165002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  31.84 
 
 		 226 aa  86.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0329  dithiobiotin synthetase  32.18 
 
 		 239 aa  86.3  3e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  30.26 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2865  dithiobiotin synthetase  32.22 
 
 		 225 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000243352  normal  0.051363 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00745  dethiobiotin synthetase  32.22 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000476961  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00762  hypothetical protein  32.22 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000475745  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0832  dithiobiotin synthetase  32.22 
 
 		 225 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  4.0116e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0841  dithiobiotin synthetase  32.22 
 
 		 225 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101687  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1373  dithiobiotin synthetase  38.99 
 
 		 235 aa  85.9  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.409918  normal  0.0708007 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0861  dithiobiotin synthetase  32.07 
 
 		 230 aa  85.9  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00211774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  32.79 
 
 		 221 aa  85.9  5e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0926  dithiobiotin synthetase  32.22 
 
 		 225 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000415248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0823  dethiobiotin synthase  27.08 
 
 		 228 aa  85.5  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  33.33 
 
 		 220 aa  85.1  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  32.06 
 
 		 234 aa  85.1  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0924  dithiobiotin synthetase  31.52 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000798071  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  30.73 
 
 		 242 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  30.46 
 
 		 239 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  33.7 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  33.88 
 
 		 232 aa  84.3  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1269  dithiobiotin synthetase  31.28 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000478349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0947  dithiobiotin synthetase  31.52 
 
 		 228 aa  84.7  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000283218  normal  0.605393 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  27.83 
 
 		 243 aa  84  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0833  dithiobiotin synthetase  30.98 
 
 		 230 aa  83.6  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108766  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  30.73 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2574  dithiobiotin synthetase  31.67 
 
 		 225 aa  84  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000268609  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  30.73 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  31.84 
 
 		 249 aa  82.8  0.000000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  30.46 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0116  dethiobiotin synthase  33.51 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.173766  normal  0.959156 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  33.51 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  28.38 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2961  dithiobiotin synthetase  31.28 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0450029  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1437  dithiobiotin synthetase  37.74 
 
 		 235 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.581627 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  31.49 
 
 		 226 aa  81.6  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  33.15 
 
 		 266 aa  80.9  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  30.17 
 
 		 245 aa  81.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1045  dethiobiotin synthetase  29.67 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  34.07 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  35.57 
 
 		 216 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  31.69 
 
 		 228 aa  80.5  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0362  dithiobiotin synthetase  30.81 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.356251  normal  0.0664813 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1921  dethiobiotin synthase  26.87 
 
 		 235 aa  80.5  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0147663  decreased coverage  0.00139462 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  33.51 
 
 		 210 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  28.92 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1508  dithiobiotin synthetase  33.14 
 
 		 226 aa  79.3  0.00000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  31.87 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  33.15 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0633  dithiobiotin synthetase  28.73 
 
 		 238 aa  78.6  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000700922  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  34.07 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  32.04 
 
 		 217 aa  77.8  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0396  dithiobiotin synthetase  32.42 
 
 		 226 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0704487  normal  0.887363 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003868  dethiobiotin synthetase  30 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0874118  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1804  dethiobiotin synthase  29.95 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.511205  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  30.53 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>