297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2098 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2098  dithiobiotin synthetase  100 
 
 		 209 aa  420  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.250318  normal  0.47001 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4239  dithiobiotin synthetase  64.25 
 
 		 212 aa  261  4e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.528424 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2815  dithiobiotin synthetase  63.77 
 
 		 212 aa  261  4.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4343  dithiobiotin synthetase  64.73 
 
 		 213 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0906504 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2821  dithiobiotin synthetase  61.35 
 
 		 212 aa  250  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2420  dithiobiotin synthetase  59.33 
 
 		 213 aa  249  3e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.401456  normal  0.0742626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2778  dithiobiotin synthetase  62.02 
 
 		 210 aa  247  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.352107  normal  0.487969 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0717  dithiobiotin synthetase  60.1 
 
 		 206 aa  247  1e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0490  dithiobiotin synthetase  57.97 
 
 		 212 aa  245  3e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0428  dithiobiotin synthetase  57.97 
 
 		 212 aa  245  3e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.804917  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3319  dithiobiotin synthetase  67.38 
 
 		 212 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1255  dithiobiotin synthetase  65.7 
 
 		 209 aa  241  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.52735 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1474  dithiobiotin synthetase  56.86 
 
 		 202 aa  228  6e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.718832 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2919  dithiobiotin synthetase  59.9 
 
 		 213 aa  214  8e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2918  dithiobiotin synthetase  59.28 
 
 		 202 aa  209  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.295464  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0621  dethiobiotin synthase  51.53 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0030  dethiobiotin synthase  50.75 
 
 		 210 aa  192  4e-48  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.82628  normal  0.806655 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2051  dethiobiotin synthase  53.04 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0366532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16731  putative dethiobiotin synthase  41.33 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1002  dethiobiotin synthase  42.42 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18711  putative dethiobiotin synthase  42.42 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1564  dethiobiotin synthase  39.8 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15911  putative dethiobiotin synthase  42.64 
 
 		 242 aa  175  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.454357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16611  putative dethiobiotin synthase  39.8 
 
 		 232 aa  173  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.258874  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04561  putative dethiobiotin synthase  46.43 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16511  putative dethiobiotin synthase  39.79 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3668  dethiobiotin synthase  43.15 
 
 		 210 aa  162  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.192292  normal  0.110167 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1910  dethiobiotin synthase  41.97 
 
 		 204 aa  159  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0036  dethiobiotin synthase  42.71 
 
 		 206 aa  159  4e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5562  dethiobiotin synthase  48.89 
 
 		 210 aa  158  6e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0811  dethiobiotin synthase  37.7 
 
 		 210 aa  154  8e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.624971  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05390  dethiobiotin synthetase  39.02 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.198587  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1047  dethiobiotin synthase  40.7 
 
 		 216 aa  147  8e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.113648  normal  0.557843 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0681  dethiobiotin synthase  39.39 
 
 		 210 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  43.55 
 
 		 474 aa  142  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1690  dethiobiotin synthase  40 
 
 		 202 aa  137  8.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.439314  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2977  dethiobiotin synthetase  43.53 
 
 		 206 aa  132  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.702038 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85593  dethiobiotin synthetase  37.97 
 
 		 217 aa  112  3e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0353  dethiobiotin synthetase  35.38 
 
 		 201 aa  112  6e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.789555  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0330  dethiobiotin synthetase  35.38 
 
 		 201 aa  112  6e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0021  dethiobiotin synthase  34.25 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00210748  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1390  dethiobiotin synthetase  35.63 
 
 		 190 aa  108  4.0000000000000004e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0617  dethiobiotin synthase  31.14 
 
 		 249 aa  108  7.000000000000001e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0451088  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1658  dethiobiotin synthetase  33.85 
 
 		 201 aa  104  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.222948  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  39.66 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0700  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate aminotransferase  36.16 
 
 		 646 aa  100  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3950  dithiobiotin synthetase  31.68 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1008  dithiobiotin synthetase  31.68 
 
 		 242 aa  98.2  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1794  dithiobiotin synthetase  28.77 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26269  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4229  dithiobiotin synthetase  32.16 
 
 		 242 aa  97.4  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4188  dithiobiotin synthetase  32.66 
 
 		 242 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0103  dethiobiotin synthase  33.5 
 
 		 241 aa  96.3  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.188104  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6892  dethiobiotin synthase  34.09 
 
 		 234 aa  95.9  4e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0153  dethiobiotin synthase  39.05 
 
 		 238 aa  95.5  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  34.74 
 
 		 242 aa  94.7  8e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2900  dithiobiotin synthetase  39.88 
 
 		 221 aa  94.7  8e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.380379  normal  0.231577 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4252  dithiobiotin synthetase  31.16 
 
 		 242 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2133  dethiobiotin synthase  39.63 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3874  dithiobiotin synthetase  32.67 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  29.15 
 
 		 217 aa  94  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0083  dethiobiotin synthase  30.93 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2053  dithiobiotin synthetase  36.84 
 
 		 217 aa  94  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0534973 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0885  dethiobiotin synthase  36.36 
 
 		 211 aa  93.2  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2812  dethiobiotin synthase  40.24 
 
 		 266 aa  93.6  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00660538  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2293  dethiobiotin synthase  37.27 
 
 		 220 aa  92.4  4e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1553  dethiobiotin synthetase  36.84 
 
 		 212 aa  91.7  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2186  dethiobiotin synthase  37.65 
 
 		 227 aa  91.3  9e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3860  dithiobiotin synthetase  30.23 
 
 		 242 aa  90.5  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4265  dithiobiotin synthetase  40.46 
 
 		 245 aa  90.9  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0554323 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3711  dethiobiotin synthase  40.23 
 
 		 237 aa  91.3  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00204232  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4142  dithiobiotin synthetase  30.23 
 
 		 242 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4027  dithiobiotin synthetase  30.23 
 
 		 242 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4340  dithiobiotin synthetase  30.23 
 
 		 242 aa  89.7  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0899  dethiobiotin synthase  40 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  36.84 
 
 		 239 aa  90.1  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2817  dithiobiotin synthetase  29.53 
 
 		 242 aa  90.5  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  36.84 
 
 		 239 aa  89.7  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0249  dithiobiotin synthetase  37.71 
 
 		 225 aa  89.4  4e-17  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1431  dethiobiotin synthetase  37.43 
 
 		 212 aa  89  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0445  dithiobiotin synthetase  39.41 
 
 		 247 aa  89  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2066  dithiobiotin synthetase  36.22 
 
 		 231 aa  88.6  6e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1314  dithiobiotin synthetase  33.64 
 
 		 226 aa  88.2  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0198365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0372  dithiobiotin synthetase  40 
 
 		 239 aa  87.4  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.356167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2876  dethiobiotin synthase  38.65 
 
 		 230 aa  86.7  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2855  dethiobiotin synthase  36.31 
 
 		 249 aa  86.7  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  36.06 
 
 		 228 aa  86.3  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1428  dithiobiotin synthetase  35.84 
 
 		 240 aa  86.3  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0682  dethiobiotin synthase  37.43 
 
 		 241 aa  86.7  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.199224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2160  dethiobiotin synthase  39.64 
 
 		 228 aa  85.9  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1009  dethiobiotin synthase  39.04 
 
 		 247 aa  85.1  6e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997802 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1133  dithiobiotin synthetase  36.42 
 
 		 226 aa  85.1  7e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1459  dethiobiotin synthase  36.99 
 
 		 244 aa  84.7  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000175087  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1097  dethiobiotin synthase  33.09 
 
 		 190 aa  84.7  9e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.110147  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3135  histidinol dehydrogenase  35.8 
 
 		 230 aa  84.7  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2454  dethiobiotin synthase  31.8 
 
 		 224 aa  84.7  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.101684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  29.69 
 
 		 243 aa  84.3  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3643  dethiobiotin synthase  40.59 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2928  dithiobiotin synthetase  35.26 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0820  dethiobiotin synthase  34.56 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.22019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2841  dithiobiotin synthetase  35.26 
 
 		 240 aa  84  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>