235 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4533 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4533  DRTGG domain-containing protein  100 
 
 
357 aa  717    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0075  DRTGG domain-containing protein  94.1 
 
 
357 aa  682    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.33059  hitchhiker  0.0000000201295 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3835  DRTGG domain protein  66.1 
 
 
356 aa  477  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379504 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3751  DRTGG domain-containing protein  54.52 
 
 
353 aa  391  1e-108  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1998  DRTGG  41.64 
 
 
364 aa  270  2e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.253796  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3303  DRTGG domain-containing protein  40 
 
 
371 aa  255  9e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3353  DRTGG domain protein  38.18 
 
 
358 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1346  cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.25 
 
 
355 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0427  DRTGG domain protein  38.66 
 
 
362 aa  239  8e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.857593 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2994  DRTGG domain protein  37.64 
 
 
356 aa  235  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3126  DRTGG domain protein  37.64 
 
 
355 aa  235  8e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1033  DRTGG domain protein  34.39 
 
 
355 aa  233  3e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00622763  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2747  DRTGG  37.11 
 
 
357 aa  233  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0443759  normal  0.208128 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2292  DRTGG domain protein  37.71 
 
 
355 aa  231  2e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1641  DRTGG domain-containing protein  34.28 
 
 
354 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163018  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1705  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  33.43 
 
 
354 aa  225  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0863  hypothetical protein  37.43 
 
 
393 aa  225  9e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00542873  normal  0.0353639 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0242  DRTGG domain protein  34.28 
 
 
354 aa  224  2e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0636501 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2427  DRTGG domain protein  32.39 
 
 
353 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.67559  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3476  DRTGG domain protein  36.36 
 
 
420 aa  212  1e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152203  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06871  phosphotransacetylase domain-containing protein  38.36 
 
 
366 aa  209  4e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0648  hypothetical protein  36.77 
 
 
371 aa  207  3e-52  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1638  DRTGG domain protein  36.54 
 
 
396 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0316  DRTGG domain protein  37.07 
 
 
353 aa  203  4e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.203818 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1866  DRTGG domain protein  33.8 
 
 
353 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2279  DRTGG domain protein  32.58 
 
 
355 aa  199  5e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0989454  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1711  hypothetical protein  35.54 
 
 
365 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3243  hypothetical protein  33.52 
 
 
353 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0645555  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05421  phosphotransacetylase domain-containing protein  33.06 
 
 
369 aa  192  6e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0479  BioD-like N-terminal domain of phosphotransacetylase  33.33 
 
 
369 aa  191  1e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05041  phosphotransacetylase domain-containing protein  33.89 
 
 
369 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1811  phosphotransacetylase domain-containing protein  34.34 
 
 
363 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00276331  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05341  phosphotransacetylase domain-containing protein  33.61 
 
 
369 aa  186  4e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05351  phosphotransacetylase domain-containing protein  33.98 
 
 
363 aa  186  8e-46  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.204674 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04791  phosphotransacetylase domain-containing protein  35.15 
 
 
363 aa  185  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0342  DRTGG domain-containing protein  32.22 
 
 
363 aa  176  7e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221378  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2082  DRTGG domain-containing protein  30.89 
 
 
349 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0896  DRTGG domain-containing protein  32.68 
 
 
351 aa  168  1e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.658378  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1699  DRTGG domain protein  34.17 
 
 
356 aa  149  8e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3046  phosphate acetyltransferase  28.92 
 
 
689 aa  92  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3240  phosphate acetyltransferase  28.07 
 
 
703 aa  91.3  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4809  phosphate acetyltransferase  22.67 
 
 
701 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932009 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  27.5 
 
 
370 aa  86.7  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2784  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  25.21 
 
 
377 aa  86.3  7e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.542112  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4138  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  27.14 
 
 
370 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1472  phosphate acetyltransferase  25.59 
 
 
699 aa  83.2  0.000000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.253391 
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48580  predicted protein  29.49 
 
 
476 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300421  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1616  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  22.26 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0924074  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  25.8 
 
 
700 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50625  predicted protein  28.51 
 
 
495 aa  78.6  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0344  phosphate acetyltransferase  25 
 
 
704 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.072273  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4480  phosphate acetyltransferase  23.47 
 
 
698 aa  78.6  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2395  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  23.27 
 
 
363 aa  77  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0460096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1824  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  23.27 
 
 
363 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00447956 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4028  phosphotransacetylase domain-containing protein  23.67 
 
 
363 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000311245  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3031  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  20.56 
 
 
363 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000498688  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0262  phosphate acetyltransferase  26.92 
 
 
683 aa  75.5  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0693  phosphate acetyltransferase  26.39 
 
 
699 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.206034  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0051  phosphate acetyltransferase  26.84 
 
 
703 aa  75.1  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.833181 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1864  phosphate acetyltransferase  24.32 
 
 
704 aa  73.9  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1681  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  23.67 
 
 
363 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.307852  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2398  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  26.72 
 
 
387 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000381603  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3473  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  23.97 
 
 
363 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2543  phosphotransacetylase domain-containing protein  22.45 
 
 
363 aa  72  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6197  phosphate acetyltransferase  27.88 
 
 
714 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1035  phosphate acetyltransferase  24.57 
 
 
702 aa  69.7  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0294331  normal  0.684952 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3529  phosphate acetyltransferase  22.01 
 
 
697 aa  69.3  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.682765  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3476  phosphate acetyltransferase  21.51 
 
 
707 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2640  phosphate acetyltransferase  21.24 
 
 
707 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.193929  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01780  phosphate acetyltransferase  26.43 
 
 
691 aa  68.6  0.0000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3241  phosphate acetyltransferase  24.24 
 
 
719 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08770  phosphotransacetylase  26.32 
 
 
691 aa  67.8  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2733  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  21.13 
 
 
369 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0579  phosphate acetyltransferase  24.81 
 
 
697 aa  66.2  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2536  dethiobiotin synthase  30.22 
 
 
226 aa  65.9  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000213384  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0813  phosphate acetyltransferase  24.48 
 
 
695 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  21.45 
 
 
364 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.796519  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0774  phosphate acetyltransferase  24.18 
 
 
695 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.81433  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0799  phosphate acetyltransferase  24.18 
 
 
695 aa  63.9  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.148954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4398  phosphate acetyltransferase  25.2 
 
 
706 aa  63.9  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10413  phosphate acetyltransferase  26.2 
 
 
690 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2097  dethiobiotin synthase  24.89 
 
 
243 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2954  phosphate acetyltransferase  26.83 
 
 
696 aa  62  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1921  dethiobiotin synthase  25.32 
 
 
235 aa  59.7  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0147663  decreased coverage  0.00139462 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3312  phosphate acetyltransferase  20.71 
 
 
720 aa  59.7  0.00000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4415  phosphate acetyltransferase  23.58 
 
 
695 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259249  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0802  phosphate acetyltransferase  22.01 
 
 
712 aa  58.9  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4084  dithiobiotin synthetase  25.85 
 
 
228 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.610971  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3645  phosphate acetyltransferase  21.43 
 
 
697 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1871  phosphate acetyltransferase  21.64 
 
 
691 aa  57.8  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4685  phosphate acetyltransferase  22.51 
 
 
704 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.633207  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1045  phosphate acetyltransferase  23.16 
 
 
702 aa  57.8  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1132  phosphate acetyltransferase  24.21 
 
 
717 aa  57.8  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1007  phosphate acetyltransferase  21.07 
 
 
696 aa  57  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2543  dethiobiotin synthase  24.04 
 
 
243 aa  57  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000737689  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0033  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  21.94 
 
 
365 aa  57  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53480  phosphate acetyltransferase  22.51 
 
 
704 aa  56.6  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0014166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0537  phosphate acetyltransferase  22.66 
 
 
704 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0549  phosphate acetyltransferase  22.66 
 
 
704 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0527  phosphate acetyltransferase  22.66 
 
 
704 aa  56.6  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>