189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2543 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2543  phosphotransacetylase domain-containing protein  100 
 
 
363 aa  733    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2395  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  75.21 
 
 
363 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0460096  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1824  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  75.48 
 
 
363 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00447956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1681  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  72.73 
 
 
363 aa  545  1e-154  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.307852  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1616  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  71.07 
 
 
363 aa  539  9.999999999999999e-153  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0924074  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4028  phosphotransacetylase domain-containing protein  64.19 
 
 
363 aa  464  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000311245  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0885  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  61.98 
 
 
364 aa  435  1e-121  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.796519  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2733  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  60.33 
 
 
369 aa  434  1e-120  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3031  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  57.85 
 
 
363 aa  431  1e-120  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000498688  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0033  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  58.68 
 
 
365 aa  410  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2398  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  54.4 
 
 
387 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000381603  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2784  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  56.32 
 
 
377 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.542112  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4048  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  53.85 
 
 
370 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4138  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  53.85 
 
 
370 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3473  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  54.55 
 
 
363 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.416548  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3278  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  60.5 
 
 
364 aa  393  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0982  BioD-like protein N-terminal domain of phosphotransacetylase-like protein  60.5 
 
 
364 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00173094  n/a   
 
 
-
 
NC_011701  PHATRDRAFT_50625  predicted protein  28.5 
 
 
495 aa  151  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_48580  predicted protein  29.22 
 
 
476 aa  135  9.999999999999999e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.0000300421  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1638  DRTGG domain protein  23.97 
 
 
396 aa  90.1  6e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3529  phosphate acetyltransferase  26.8 
 
 
697 aa  87.8  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.682765  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0316  DRTGG domain protein  25.39 
 
 
353 aa  87.4  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.203818 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1035  phosphate acetyltransferase  24.36 
 
 
702 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0294331  normal  0.684952 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3751  DRTGG domain-containing protein  21.21 
 
 
353 aa  81.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2427  DRTGG domain protein  22.03 
 
 
353 aa  79.7  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.67559  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1472  phosphate acetyltransferase  22.57 
 
 
699 aa  79.7  0.00000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.253391 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1705  cobyrinic acid a,c-diamide synthase family protein  23.24 
 
 
354 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3353  DRTGG domain protein  21.01 
 
 
358 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4809  phosphate acetyltransferase  22.07 
 
 
701 aa  76.6  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.932009 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2292  DRTGG domain protein  21.99 
 
 
355 aa  75.9  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0242  DRTGG domain protein  21.31 
 
 
354 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0636501 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3476  DRTGG domain protein  28.47 
 
 
420 aa  73.9  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152203  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3240  phosphate acetyltransferase  25.42 
 
 
703 aa  73.6  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2279  DRTGG domain protein  26.39 
 
 
355 aa  72  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0989454  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1864  phosphate acetyltransferase  23.04 
 
 
704 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3476  phosphate acetyltransferase  20.79 
 
 
707 aa  71.6  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3241  phosphate acetyltransferase  23.99 
 
 
719 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4533  DRTGG domain-containing protein  22.45 
 
 
357 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0075  DRTGG domain-containing protein  23.27 
 
 
357 aa  71.6  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.33059  hitchhiker  0.0000000201295 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2640  phosphate acetyltransferase  21.07 
 
 
707 aa  70.1  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.193929  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0344  phosphate acetyltransferase  23.81 
 
 
704 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.072273  normal  0.492419 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1132  phosphate acetyltransferase  23.24 
 
 
717 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4480  phosphate acetyltransferase  22.16 
 
 
698 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1641  DRTGG domain-containing protein  21.04 
 
 
354 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.163018  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1048  phosphate acetyltransferase  22.66 
 
 
700 aa  67.4  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3835  DRTGG domain protein  18.41 
 
 
356 aa  66.2  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000379504 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01780  phosphate acetyltransferase  21.26 
 
 
691 aa  65.1  0.000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2577  phosphate acetyltransferase  22.99 
 
 
695 aa  64.3  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.901463 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0297  phosphate acetyltransferase  23.66 
 
 
702 aa  63.5  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.954755  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3046  phosphate acetyltransferase  22.7 
 
 
689 aa  63.2  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1346  cobyrinic acid ac-diamide synthase  21.11 
 
 
355 aa  62.4  0.00000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1045  phosphate acetyltransferase  19.66 
 
 
702 aa  61.2  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3243  hypothetical protein  27.12 
 
 
353 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0645555  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1871  phosphate acetyltransferase  22.73 
 
 
691 aa  60.5  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2165  dethiobiotin synthase  30.19 
 
 
239 aa  60.5  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1998  DRTGG  19.54 
 
 
364 aa  59.7  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.253796  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0643  phosphate acetyltransferase  22.75 
 
 
699 aa  58.2  0.0000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.65849  normal  0.312772 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2747  DRTGG  21.29 
 
 
357 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0443759  normal  0.208128 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1866  DRTGG domain protein  22.58 
 
 
353 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1711  hypothetical protein  22.36 
 
 
365 aa  57.8  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0051  phosphate acetyltransferase  23.1 
 
 
703 aa  56.6  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.833181 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0802  phosphate acetyltransferase  22 
 
 
712 aa  56.6  0.0000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2369  dethiobiotin synthase  25.77 
 
 
264 aa  56.6  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0971494  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2052  dethiobiotin synthase  29.25 
 
 
239 aa  55.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1327  dethiobiotin synthase  28.33 
 
 
263 aa  56.2  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45576  predicted protein  23.83 
 
 
490 aa  55.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0643  phosphate acetyltransferase  23.12 
 
 
687 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0579  phosphate acetyltransferase  22.44 
 
 
697 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10413  phosphate acetyltransferase  20.8 
 
 
690 aa  54.7  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11260  phosphotransacetylase  23.85 
 
 
695 aa  55.1  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.182034  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1176  dethiobiotin synthase  27.85 
 
 
243 aa  54.3  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.592702  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3645  phosphate acetyltransferase  23.37 
 
 
697 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1836  dethiobiotin synthase  25.94 
 
 
242 aa  53.9  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.354399  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0342  DRTGG domain-containing protein  22.57 
 
 
363 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221378  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  26.73 
 
 
513 aa  53.5  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1033  DRTGG domain protein  21.92 
 
 
355 aa  53.5  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00622763  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3762  phosphate acetyltransferase  21.85 
 
 
709 aa  53.1  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1157  dethiobiotin synthase  31.49 
 
 
217 aa  53.1  0.000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.125346  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41130  phosphate acetyltransferase  25.36 
 
 
691 aa  52.8  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.735212  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3048  phosphate acetyltransferase  21.52 
 
 
701 aa  53.1  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0392547 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0196  phosphate acetyltransferase  23.39 
 
 
718 aa  52.8  0.000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.027036 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28500  phosphotransacetylase  23.02 
 
 
731 aa  52.8  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.157422 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0896  DRTGG domain-containing protein  20.38 
 
 
351 aa  52.8  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.658378  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0774  phosphate acetyltransferase  23.14 
 
 
695 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.81433  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0880  phosphate acetyltransferase  24.34 
 
 
699 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.840822 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1099  hypothetical protein  26.15 
 
 
277 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.840319  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1996  dithiobiotin synthetase  26.67 
 
 
225 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1581  dethiobiotin synthase  31.45 
 
 
241 aa  51.6  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.413996 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0216  phosphate acetyltransferase  24.73 
 
 
718 aa  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2082  DRTGG domain-containing protein  23.06 
 
 
349 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0799  phosphate acetyltransferase  23.14 
 
 
695 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.148954 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04791  phosphotransacetylase domain-containing protein  22.69 
 
 
363 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0813  phosphate acetyltransferase  23.14 
 
 
695 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0863  hypothetical protein  19.95 
 
 
393 aa  51.2  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00542873  normal  0.0353639 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1842  dithiobiotin synthetase  24.54 
 
 
244 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.709275  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0648  hypothetical protein  21.99 
 
 
371 aa  50.8  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4685  phosphate acetyltransferase  21.77 
 
 
704 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.633207  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0883  dethiobiotin synthase  28.65 
 
 
212 aa  50.4  0.00005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.619901  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1699  DRTGG domain protein  23.36 
 
 
356 aa  49.7  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4415  phosphate acetyltransferase  22.38 
 
 
695 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.259249  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>