69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0776 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0776  transcription regulator  100 
 
 
419 aa  855    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1517  transcription regulator  44.78 
 
 
426 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0152362  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0845  CBS domain-containing protein  43.56 
 
 
427 aa  332  6e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4720  thioesterase family protein  36.72 
 
 
437 aa  291  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4353  CBS domain-containing cytosolic protein  36.97 
 
 
437 aa  290  4e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4739  thioesterase family protein  36.72 
 
 
437 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4744  thioesterase family protein  36.72 
 
 
437 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4505  thioesterase family protein  36.97 
 
 
437 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4341  CBS domain-containing cytosolic protein  36.97 
 
 
437 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0517  thioesterase family protein  36.48 
 
 
437 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4727  thioesterase family protein  36.97 
 
 
437 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4858  thioesterase family protein  36.97 
 
 
437 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2357  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  38.67 
 
 
435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.889148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4440  signal-transduction protein  35.73 
 
 
437 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1795  DRTGG domain-containing protein  38.42 
 
 
432 aa  283  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1761  DRTGG domain-containing protein  38.42 
 
 
432 aa  283  5.000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.540009  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3293  DRTGG domain-containing protein  35.48 
 
 
437 aa  279  5e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.113005  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2695  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  36.39 
 
 
438 aa  277  3e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0768  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  37.66 
 
 
435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1268  CBS domain-containing protein  34.18 
 
 
432 aa  263  3e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0546  putative signal-transduction protein with CBS and DRTGG domains  31.77 
 
 
434 aa  238  1e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.865084 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1191  DRTGG domain-containing protein  30.92 
 
 
435 aa  226  8e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2409  putative signal transduction protein with CBS and DRTGG domains  34.38 
 
 
437 aa  216  5e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000183212  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2027  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  32.17 
 
 
549 aa  65.5  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1712  Inorganic diphosphatase  25 
 
 
542 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2312  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  30.77 
 
 
549 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1699  DRTGG domain protein  37.04 
 
 
356 aa  53.5  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0248  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  26.53 
 
 
548 aa  53.1  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0612  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  38.83 
 
 
548 aa  52.4  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  28.8 
 
 
489 aa  52.8  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0693  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  23.22 
 
 
539 aa  52.4  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0417548  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2618  CBS  32.99 
 
 
275 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1987  CBS domain-containing protein  30.1 
 
 
262 aa  51.2  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2623  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  29.45 
 
 
548 aa  51.2  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.606962  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0626  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  36.89 
 
 
548 aa  51.2  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.1938200000000002e-34 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1515  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  23.59 
 
 
544 aa  50.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1159  magnesium transporter  25 
 
 
450 aa  50.4  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0503  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  31.43 
 
 
548 aa  50.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.387626  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4157  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  36.27 
 
 
548 aa  50.1  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2975  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  34.65 
 
 
550 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2279  DRTGG domain protein  33.88 
 
 
355 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0989454  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0753  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  31.62 
 
 
550 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0152908  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2864  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  23.68 
 
 
548 aa  49.7  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000305712  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1659  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  41.18 
 
 
548 aa  48.9  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000676468  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0898  CBS domain-containing protein  28 
 
 
266 aa  48.5  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2082  DRTGG domain-containing protein  31.13 
 
 
349 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2292  DRTGG domain protein  31.58 
 
 
355 aa  46.6  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1290  CBS domain-containing protein  28.44 
 
 
264 aa  45.4  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.382555 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2097  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  25.83 
 
 
537 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0342  DRTGG domain-containing protein  29.9 
 
 
363 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.221378  normal  0.664037 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0737a  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  28.24 
 
 
487 aa  44.7  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0296  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  29.24 
 
 
489 aa  45.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1866  DRTGG domain protein  26.37 
 
 
353 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1295  hypothetical protein  28.87 
 
 
512 aa  44.7  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.583611 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3046  phosphate acetyltransferase  28.45 
 
 
689 aa  44.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0826  putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase  21.59 
 
 
540 aa  45.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312517  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1346  cobyrinic acid ac-diamide synthase  30.19 
 
 
355 aa  44.3  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  24.62 
 
 
373 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2169  putative signal transduction protein with CBS domains  25.71 
 
 
261 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1299  CBS domain-containing protein  27.97 
 
 
264 aa  43.9  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2427  DRTGG domain protein  30.93 
 
 
353 aa  43.9  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.67559  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3476  DRTGG domain protein  32.67 
 
 
420 aa  43.9  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.152203  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  26.79 
 
 
577 aa  43.5  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0666  CBS domain-containing protein  28.44 
 
 
264 aa  43.5  0.007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1245  signal-transduction protein  30.43 
 
 
155 aa  43.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3751  DRTGG domain-containing protein  31.82 
 
 
353 aa  43.5  0.008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  25 
 
 
161 aa  43.1  0.008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1386  CBS domain-containing protein  27.52 
 
 
264 aa  43.1  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2388  Polynucleotide adenylyltransferase region  22.15 
 
 
903 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.991166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>