19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0918 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0918  hypothetical protein  100 
 
 
391 aa  793    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00435551  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1331  hypothetical protein  32.9 
 
 
390 aa  155  1e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.252381  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0402  hypothetical protein  27.21 
 
 
384 aa  125  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2897  hypothetical protein  27.01 
 
 
378 aa  112  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.200479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6751  hypothetical protein  27.21 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.151954 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3609  hypothetical protein  22.97 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0518753  normal  0.506408 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2532  Peptide chain release factor 1 (eRF1)-like protein  24.54 
 
 
405 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.023153  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4445  hypothetical protein  29.23 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4458  hypothetical protein  26.2 
 
 
417 aa  64.7  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.555238  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1115  hypothetical protein  24.61 
 
 
536 aa  64.3  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4439  hypothetical protein  26.52 
 
 
417 aa  58.5  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.580463  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1561  hypothetical protein  21.21 
 
 
369 aa  56.6  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2929  hypothetical protein  28.27 
 
 
364 aa  56.6  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.652299  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0453  peptide chain release factor 1  26.67 
 
 
419 aa  50.1  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1536  peptide chain release factor 1  26.11 
 
 
419 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0453  peptide chain release factor 1  26.47 
 
 
419 aa  47.4  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0383  peptide chain release factor 1  25.56 
 
 
419 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.344254 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0601  hypothetical protein  21.48 
 
 
388 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.427399  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0519  peptide chain release factor 1  30.2 
 
 
410 aa  43.1  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>