More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2324 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 173 aa  334  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3144  Camphor resistance CrcB protein  56.08 
 
 		 155 aa  121  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  52.03 
 
 		 170 aa  115  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1440  camphor resistance CrcB protein  47.26 
 
 		 208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  50.85 
 
 		 126 aa  104  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2515  camphor resistance CrcB protein  51.38 
 
 		 167 aa  99  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0650732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  48.15 
 
 		 169 aa  96.7  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5463  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation-like protein  58.23 
 
 		 156 aa  92  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0532023 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  44.07 
 
 		 127 aa  89  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  45.31 
 
 		 166 aa  85.1  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 152 aa  79  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  41.44 
 
 		 131 aa  77.8  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  40.54 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3965  Camphor resistance CrcB protein  42.11 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00934681  normal  0.343855 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 		 128 aa  74.3  0.0000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  38.68 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  39.09 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  46.32 
 
 		 133 aa  72  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3030  camphor resistance protein CrcB  48.24 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  33.33 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  33.33 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  38.74 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  37.93 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  37.69 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  39.13 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  37.69 
 
 		 138 aa  68.2  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  42.02 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  35.48 
 
 		 123 aa  67.4  0.0000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5763  Camphor resistance CrcB protein  45.54 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  36.94 
 
 		 128 aa  67  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  32.38 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  41.46 
 
 		 122 aa  67  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  37.29 
 
 		 193 aa  67  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  34.53 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  41 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  36.73 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 130 aa  65.5  0.0000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  40.17 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  36.13 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  40.48 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  34.43 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  44.68 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  38.18 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2061  Camphor resistance CrcB protein  47.31 
 
 		 133 aa  64.3  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000432443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  38.61 
 
 		 130 aa  64.3  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  38.04 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 123 aa  64.3  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  45.83 
 
 		 127 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 126 aa  63.9  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  41.44 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0072  CrcB protein  44.09 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  36.79 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 129 aa  62.8  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  35.66 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  36.79 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  39.37 
 
 		 136 aa  62  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  34.82 
 
 		 124 aa  62  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  37.61 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  40.59 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  36.7 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  38.79 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  37.5 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  38.32 
 
 		 162 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  42.42 
 
 		 121 aa  60.5  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  39.83 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  35.16 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  34.13 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  34.21 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  35.34 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  36.63 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 		 124 aa  58.9  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  33.64 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1326  crcB protein  42.86 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  34.82 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1370  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1311  CrcB protein  45.21 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  34.4 
 
 		 127 aa  57.4  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 		 128 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  35.05 
 
 		 109 aa  57.4  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0526  Camphor resistance CrcB protein  36.52 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0550808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  34.65 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>