More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3176 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 124 aa  236  5.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  97.58 
 
 		 124 aa  231  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  85.48 
 
 		 124 aa  213  8e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  78.86 
 
 		 124 aa  192  9e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  78.86 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  78.86 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  73.39 
 
 		 124 aa  180  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  57.94 
 
 		 127 aa  133  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  43.09 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  39.13 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3405  CrcB protein  75.44 
 
 		 66 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.356254 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  42.28 
 
 		 125 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  40.5 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  40.98 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 		 137 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 140 aa  74.7  0.0000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 144 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  33.61 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  35.09 
 
 		 137 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  38.71 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  39.84 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  35.09 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  29.82 
 
 		 134 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  39.37 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  34.15 
 
 		 193 aa  67.4  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 146 aa  67  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  37.5 
 
 		 123 aa  67  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  35.09 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 		 135 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  39.47 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  31.62 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  34.45 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  36.44 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  36.44 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  37.29 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  33.62 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  38 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1374  camphor resistance protein CrcB  44.58 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2486  camphor resistance protein CrcB  44.58 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 137 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 144 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 		 154 aa  62.8  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  37.9 
 
 		 162 aa  62.8  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  39.53 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  31.03 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  41.28 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2660  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28327  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1284  integral membrane protein for chromosome condensation  34.75 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  36.46 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  30.95 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  33.9 
 
 		 126 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  36 
 
 		 126 aa  60.1  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  33.9 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2393  Camphor resistance CrcB protein  41.67 
 
 		 133 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00142578 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  40.43 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  33.86 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  35.83 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  36.44 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  43.36 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  36.46 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3963  Camphor resistance CrcB protein  35.59 
 
 		 115 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3446  camphor resistance protein CrcB  40.24 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  35.2 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1465  CrcB protein  42.35 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  35.24 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  35.2 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  33.87 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  35.29 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  37.37 
 
 		 228 aa  57.4  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  37.7 
 
 		 130 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  45.35 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  37.23 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  38.14 
 
 		 117 aa  56.2  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  30.33 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  33.91 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  33.04 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  35.64 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>