More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3454 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  265  1e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  56.62 
 
 		 142 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  57.14 
 
 		 138 aa  130  5e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  54.69 
 
 		 270 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 132 aa  116  9e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  47.29 
 
 		 131 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0818  camphor resistance protein CrcB  48.46 
 
 		 137 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.682767  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0768  camphor resistance protein CrcB  48.46 
 
 		 144 aa  112  2.0000000000000002e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  48.78 
 
 		 129 aa  101  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  49.57 
 
 		 134 aa  97.1  8e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  50.44 
 
 		 128 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  48.72 
 
 		 126 aa  94  7e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  45.45 
 
 		 143 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  46.02 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  46.9 
 
 		 125 aa  89  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1527  Camphor resistance CrcB protein  47.46 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  49.22 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  43.8 
 
 		 142 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  44.26 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  44.8 
 
 		 133 aa  83.6  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  46.55 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  46.9 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  46.9 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  43.55 
 
 		 132 aa  80.9  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  48.25 
 
 		 140 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  49.5 
 
 		 122 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  43.44 
 
 		 193 aa  79.7  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  44.54 
 
 		 123 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  37.39 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  42.48 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  44.12 
 
 		 127 aa  78.6  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  42.15 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  41.04 
 
 		 131 aa  77.4  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  41.88 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  44.17 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0201  camphor resistance CrcB protein  40.8 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  34.92 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  48.54 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  49.12 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  42.48 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  46.53 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  46.23 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  49.46 
 
 		 107 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  40.5 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  39.67 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  47.12 
 
 		 129 aa  72  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  41.07 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  37.3 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  38.24 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  52.27 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  50.6 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  38.76 
 
 		 130 aa  70.1  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  41.18 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  41.35 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  51.69 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  41.07 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  34.59 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  44.14 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  45.36 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  36.79 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  45.19 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2422  hypothetical protein  39.85 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  43.93 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  36.79 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  38.02 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  40.48 
 
 		 132 aa  68.6  0.00000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  40.43 
 
 		 99 aa  68.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>