More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0200 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
128 aa  246  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  66.67 
 
 
130 aa  169  2e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  60.8 
 
 
127 aa  152  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  63.11 
 
 
129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  58.59 
 
 
129 aa  143  7.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  54.4 
 
 
129 aa  140  7e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0191  camphor resistance protein CrcB  65.62 
 
 
128 aa  139  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  43.75 
 
 
124 aa  92  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  50.96 
 
 
140 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  42.06 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  43.69 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 
128 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  43.69 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  38.79 
 
 
134 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  37.3 
 
 
125 aa  85.1  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 
128 aa  84.7  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  39.5 
 
 
132 aa  84  6e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  43.7 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  44.04 
 
 
129 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  39.17 
 
 
151 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  45.76 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 
128 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 
140 aa  81.6  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  45.63 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
122 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  43.93 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  45.63 
 
 
125 aa  81.3  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  33.91 
 
 
123 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  37.7 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  42.28 
 
 
121 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  42.4 
 
 
133 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  37.82 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  44.54 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  42.15 
 
 
122 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  42.73 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1480  CrcB protein  43.55 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  36.75 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  40.34 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  47.22 
 
 
126 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 
162 aa  76.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  39.09 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  43.33 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  36.22 
 
 
130 aa  76.3  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  39.09 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  37.86 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  37.86 
 
 
130 aa  75.5  0.0000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  40.34 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  48.94 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  42.11 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1465  CrcB protein  47.73 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  38.18 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  40 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  48.94 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  42.11 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  39.02 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  41.8 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  33.87 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  32 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  38.6 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  47.62 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  44.23 
 
 
131 aa  73.6  0.0000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  38.84 
 
 
125 aa  73.6  0.0000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  32.28 
 
 
162 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  40.86 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  35.29 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 
124 aa  72  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  37.19 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  43.75 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  41.75 
 
 
173 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  35.45 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  38.83 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  36.44 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  40.21 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  38.3 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  35.34 
 
 
126 aa  70.1  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 
132 aa  69.7  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  34.69 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  42.55 
 
 
142 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  41.96 
 
 
132 aa  69.3  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  38.21 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  34.65 
 
 
142 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>