More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0767 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  100 
 
 
132 aa  259  6.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  47.93 
 
 
123 aa  112  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  45.16 
 
 
124 aa  105  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  46.28 
 
 
140 aa  103  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  47.66 
 
 
228 aa  102  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  42.98 
 
 
123 aa  97.8  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  46.43 
 
 
124 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 
124 aa  94.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  45.13 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  45.13 
 
 
124 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  44.25 
 
 
124 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  38.46 
 
 
124 aa  90.5  7e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  42.34 
 
 
129 aa  89.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  43.24 
 
 
125 aa  88.6  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 
134 aa  87.8  5e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  45.08 
 
 
127 aa  87.4  5e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  40.87 
 
 
143 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  46.49 
 
 
122 aa  86.3  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 
125 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  44.74 
 
 
122 aa  85.1  3e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  41.09 
 
 
133 aa  84.7  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  46.49 
 
 
122 aa  84.3  5e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  41.8 
 
 
122 aa  84  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
124 aa  83.6  8e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  40.52 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  45.74 
 
 
125 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  42.74 
 
 
128 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  40 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  41.82 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  43.55 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 
128 aa  80.9  0.000000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  41.12 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  42.98 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  43.36 
 
 
132 aa  79.7  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  39.34 
 
 
127 aa  80.1  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  40 
 
 
142 aa  79.7  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  42.48 
 
 
128 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  42.61 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  42.61 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  37.6 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  34.65 
 
 
193 aa  78.2  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  40.87 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  37.6 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1007  CrcB protein  37.5 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.83695  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  42.34 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 
127 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  39.06 
 
 
137 aa  77  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  41.46 
 
 
117 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  37.8 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  37.4 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  36.44 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 
125 aa  75.5  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  42.48 
 
 
133 aa  75.1  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
126 aa  74.7  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  37.74 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  41.44 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  39.25 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  41.23 
 
 
121 aa  73.9  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  39.25 
 
 
125 aa  74.3  0.0000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  37.38 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  37.38 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  34.48 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  42.73 
 
 
131 aa  73.6  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 
123 aa  72.8  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  42.73 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  32 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  39.13 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 
128 aa  72  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  40.87 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  36.29 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  40.62 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  33.65 
 
 
124 aa  70.5  0.000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  38.61 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 
122 aa  70.1  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  35.83 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  42.7 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  42.7 
 
 
130 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  35.83 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  37.5 
 
 
138 aa  69.7  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  45.05 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  41.18 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  38.71 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>