247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2707 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  100 
 
 		 127 aa  251  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  39.84 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1440  camphor resistance CrcB protein  43.9 
 
 		 208 aa  88.6  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3144  Camphor resistance CrcB protein  49.06 
 
 		 155 aa  86.7  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  46.08 
 
 		 173 aa  85.1  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2061  Camphor resistance CrcB protein  46.67 
 
 		 133 aa  80.5  0.000000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000432443  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  38.94 
 
 		 166 aa  77  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 		 170 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  40.52 
 
 		 169 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  34.65 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  37.21 
 
 		 138 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2515  camphor resistance CrcB protein  43.53 
 
 		 167 aa  65.1  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0650732  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  31.9 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 125 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  30.17 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 134 aa  61.6  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  35.43 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  34.96 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  35.43 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  37.61 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  30.83 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  32.81 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3030  camphor resistance protein CrcB  42.67 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  32.23 
 
 		 122 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  36.21 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  34.13 
 
 		 152 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  32.81 
 
 		 131 aa  59.7  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  29.31 
 
 		 126 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  32.23 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  31.4 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  33.05 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  30.83 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  37.74 
 
 		 107 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  35.04 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  34.96 
 
 		 270 aa  57  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  39.22 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  31.71 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 		 132 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  33.88 
 
 		 126 aa  56.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3963  Camphor resistance CrcB protein  31.3 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  33.88 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  31.97 
 
 		 130 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  35.65 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  34.31 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  31.93 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  33.62 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  33.03 
 
 		 127 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  32.8 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  26.23 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1416  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0277002  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  35.59 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  35.96 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  34.31 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  29.41 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  29.41 
 
 		 147 aa  53.9  0.0000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 130 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  27.78 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3965  Camphor resistance CrcB protein  32.69 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00934681  normal  0.343855 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  29.63 
 
 		 151 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  30.08 
 
 		 125 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  34.4 
 
 		 131 aa  52.4  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0191  camphor resistance protein CrcB  30.77 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A24  camphor resistance protein CrcB  27.07 
 
 		 133 aa  51.6  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  30.65 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  24.56 
 
 		 128 aa  50.8  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  33.06 
 
 		 193 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  34.31 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  33.04 
 
 		 122 aa  50.8  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  29.66 
 
 		 126 aa  50.8  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  34.09 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  34.45 
 
 		 154 aa  50.4  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5463  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation-like protein  36 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0532023 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  29.75 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  40.51 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  30.77 
 
 		 124 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  26.5 
 
 		 124 aa  50.1  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0241  Camphor resistance CrcB protein  36.84 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17591  hypothetical protein  29.59 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.212024  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  29.91 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3565  camphor resistance protein CrcB  26.72 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00692175  normal  0.464407 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  29.23 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1142  camphor resistance protein CrcB  26.72 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.747152  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  34.43 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  28.69 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  29.52 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1088  camphor resistance protein CrcB  26.72 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.97219  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  29.91 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  34.43 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  34.43 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  32.35 
 
 		 142 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  29.03 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>