More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5873 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  100 
 
 
126 aa  240  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3144  Camphor resistance CrcB protein  62 
 
 
155 aa  106  8.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1440  camphor resistance CrcB protein  53.45 
 
 
208 aa  100  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  51.92 
 
 
173 aa  100  9e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  50 
 
 
169 aa  98.6  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
170 aa  94.7  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2515  camphor resistance CrcB protein  59.04 
 
 
167 aa  91.7  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0650732  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  39.84 
 
 
127 aa  90.9  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 
131 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  44.25 
 
 
166 aa  84  6e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  46.34 
 
 
124 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  46.34 
 
 
124 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  46.34 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  35.77 
 
 
152 aa  80.5  0.000000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 
128 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  43.7 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5463  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation-like protein  51 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0532023 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  43.7 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2061  Camphor resistance CrcB protein  46.99 
 
 
133 aa  74.3  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000432443  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 
125 aa  72  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3030  camphor resistance protein CrcB  47.78 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  38.3 
 
 
122 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  40.16 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  40.62 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  46.67 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  46.67 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 
128 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  37.74 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  43.09 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  43.09 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 
125 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  36.21 
 
 
123 aa  69.3  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  38.84 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  37.6 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  30.7 
 
 
128 aa  68.6  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  42.37 
 
 
124 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  33.33 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 
128 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  40.18 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  33.06 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1325  camphor resistance protein CrcB  34.21 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  44.57 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  33.33 
 
 
126 aa  65.5  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  38.4 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  36.52 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  33.33 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  35 
 
 
132 aa  63.9  0.0000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  36.94 
 
 
144 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5763  Camphor resistance CrcB protein  41.24 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  32.8 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
140 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  32.69 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  32.69 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5014  Camphor resistance CrcB protein  49.45 
 
 
125 aa  62.8  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  31.3 
 
 
122 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  40.68 
 
 
133 aa  62.8  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  35 
 
 
151 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  37.63 
 
 
117 aa  62.8  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  35.09 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  34.11 
 
 
128 aa  62.8  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  27.5 
 
 
134 aa  62.8  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  33.93 
 
 
124 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  38.3 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
126 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  33.62 
 
 
130 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  39.83 
 
 
121 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  33.93 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  35.14 
 
 
137 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  31.73 
 
 
130 aa  60.8  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  35.45 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  36.84 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2392  Camphor resistance CrcB protein  44.05 
 
 
144 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145973 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  39.25 
 
 
122 aa  60.5  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1369  crcB family protein  34.34 
 
 
254 aa  60.5  0.000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  35.14 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0072  CrcB protein  40 
 
 
146 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  35.48 
 
 
128 aa  59.7  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  30.97 
 
 
118 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  37.21 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  38.3 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  31.45 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  34.4 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>