More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2259 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  100 
 
 		 125 aa  240  3.9999999999999997e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  60.48 
 
 		 125 aa  146  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  59.68 
 
 		 125 aa  144  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  51.67 
 
 		 128 aa  116  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  46.28 
 
 		 134 aa  99  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  45.9 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  48.15 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  45.08 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  45.08 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  44.17 
 
 		 128 aa  95.1  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  44.54 
 
 		 126 aa  94  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  41.94 
 
 		 132 aa  90.1  8e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 		 124 aa  90.1  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  45.79 
 
 		 125 aa  87.4  5e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  46.83 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  41.53 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  42.62 
 
 		 133 aa  84.3  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  45.24 
 
 		 128 aa  83.6  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  46.39 
 
 		 124 aa  83.6  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  41.94 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 130 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  41.38 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  40.68 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  40.32 
 
 		 140 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 127 aa  79.7  0.00000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  38.71 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  34.96 
 
 		 130 aa  79.3  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  38.71 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  41.38 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  42.24 
 
 		 133 aa  79  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  45.36 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  40.94 
 
 		 128 aa  78.2  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  41.38 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  40.91 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  42.73 
 
 		 154 aa  77.8  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  41.12 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  41.88 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  31.45 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  36.89 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  43.93 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  39.52 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  37.4 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  42.55 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  40.52 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  33.9 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  40.57 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  37.93 
 
 		 140 aa  75.1  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  41.49 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  46.74 
 
 		 105 aa  75.1  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 128 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  41.28 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  39.83 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 130 aa  74.3  0.0000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  34.68 
 
 		 130 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 129 aa  73.9  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  34.41 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0708  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0797  camphor resistance protein CrcB  44.83 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  38.28 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  37.5 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  39.18 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  41.46 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  38.14 
 
 		 118 aa  72  0.000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  43.43 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  38.1 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 131 aa  71.2  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  37.5 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  40.66 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0526  Camphor resistance CrcB protein  40.91 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0550808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1434  camphor resistance protein CrcB  40.32 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  38.33 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  42.27 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  41.8 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  40.19 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  38.66 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  30.36 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 		 134 aa  68.6  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>