More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5463 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5463  Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation-like protein  100 
 
 
156 aa  298  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0532023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  56.78 
 
 
173 aa  123  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1440  camphor resistance CrcB protein  47.1 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2957  camphor resistance protein CrcB  52.31 
 
 
170 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3144  Camphor resistance CrcB protein  51.82 
 
 
155 aa  107  5e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0330494  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  52.07 
 
 
126 aa  105  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3965  Camphor resistance CrcB protein  47.47 
 
 
179 aa  94  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00934681  normal  0.343855 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2697  camphor resistance CrcB protein  45.45 
 
 
169 aa  90.9  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.428157  hitchhiker  0.000365782 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2515  camphor resistance CrcB protein  42.59 
 
 
167 aa  87.4  6e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0650732  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 
128 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  38.17 
 
 
134 aa  80.5  0.000000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  41.27 
 
 
125 aa  80.1  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 
131 aa  78.2  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
126 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0072  CrcB protein  45.63 
 
 
146 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.457407  normal  0.196927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  43.86 
 
 
166 aa  77  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7365  Camphor resistance CrcB protein  43.48 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2707  crcB protein  38.84 
 
 
127 aa  73.6  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  36.61 
 
 
122 aa  72  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  43.44 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  42.02 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
152 aa  70.1  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  42.5 
 
 
121 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  31.78 
 
 
132 aa  68.9  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  32.89 
 
 
162 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2392  Camphor resistance CrcB protein  43.43 
 
 
144 aa  66.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00145973 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  40 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  36.59 
 
 
131 aa  66.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  38.33 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  41.82 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  42.37 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  38.14 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  41.84 
 
 
123 aa  64.3  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  36.07 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  36.07 
 
 
125 aa  64.3  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  38.78 
 
 
126 aa  64.3  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  37.19 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  40.87 
 
 
129 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2061  Camphor resistance CrcB protein  41.38 
 
 
133 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000432443  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  34.19 
 
 
123 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  33.05 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  37.96 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  38.3 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  35.61 
 
 
142 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  38.39 
 
 
130 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 
128 aa  61.6  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  35.25 
 
 
128 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  40.37 
 
 
126 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  39.06 
 
 
138 aa  60.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  40.57 
 
 
114 aa  60.5  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 
124 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  45.54 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2659  camphor resistance protein CrcB  42.05 
 
 
139 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.298553  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  36.67 
 
 
124 aa  59.7  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  40.23 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  38.2 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  35.16 
 
 
127 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  35.71 
 
 
122 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  34.45 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  40.23 
 
 
107 aa  58.9  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  24.79 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  37.39 
 
 
131 aa  58.2  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  39.2 
 
 
136 aa  58.2  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 
126 aa  58.2  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  37.84 
 
 
125 aa  57.4  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  41.9 
 
 
126 aa  57.8  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 
124 aa  57.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  34.69 
 
 
99 aa  57.4  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  32.81 
 
 
127 aa  57  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 
124 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4408  camphor resistance protein CrcB  43.82 
 
 
122 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  31.4 
 
 
132 aa  57  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  38.46 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 
124 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 
124 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  35.59 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  30.08 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  41.9 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  39.53 
 
 
124 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  38.26 
 
 
131 aa  56.2  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  33.05 
 
 
125 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  33.63 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  40.22 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  37.9 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  30.08 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0768  camphor resistance protein CrcB  35.37 
 
 
144 aa  54.7  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>