More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0217 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 134 aa  257  4e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  87.3 
 
 		 126 aa  221  3e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  54.55 
 
 		 128 aa  123  8.000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  52.5 
 
 		 125 aa  118  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  52.5 
 
 		 125 aa  116  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  47.5 
 
 		 124 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  48.6 
 
 		 124 aa  104  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  48.33 
 
 		 124 aa  103  8e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  48.39 
 
 		 131 aa  103  9e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  49.53 
 
 		 127 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  48.31 
 
 		 124 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  46.28 
 
 		 125 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  45.22 
 
 		 128 aa  97.8  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  47.46 
 
 		 124 aa  97.4  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  49.57 
 
 		 136 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  47.06 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  47.06 
 
 		 124 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  49.56 
 
 		 122 aa  93.6  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  51.64 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  42.98 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  44.63 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  53.23 
 
 		 124 aa  90.9  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  48.67 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 125 aa  90.1  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  43.55 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  51.06 
 
 		 107 aa  89  2e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  45.53 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  46.77 
 
 		 140 aa  87.8  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  48.21 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  49.47 
 
 		 142 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  53.09 
 
 		 113 aa  87  9e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  50.48 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  49.54 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  44.44 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 123 aa  84.3  4e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  43.44 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  47.25 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  44.07 
 
 		 132 aa  82.4  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  47.62 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  45.56 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  45.56 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  44.44 
 
 		 109 aa  77.8  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  39.13 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  46.6 
 
 		 121 aa  77.4  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  42.86 
 
 		 138 aa  77  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  41.9 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0818  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 137 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.682767  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  42.74 
 
 		 193 aa  76.3  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0768  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 144 aa  76.3  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  43.8 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  42.86 
 
 		 129 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  36.44 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  37.61 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  40.38 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  36.44 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  41.12 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  38.79 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  40.87 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1311  CrcB protein  55.56 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  44.04 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  40.38 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  44.44 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  41.12 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  35.96 
 
 		 118 aa  72  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  38.52 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 137 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  41.32 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  41.18 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  42.71 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  35.54 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  37.82 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  40.62 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  39.05 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  41.05 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  41.8 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  41.05 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  39.13 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0015  camphor resistance CrcB protein  37.19 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  34.13 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  42.99 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  35.29 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>