More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2801 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 125 aa  233  7e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  65.18 
 
 		 113 aa  131  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  55.14 
 
 		 128 aa  103  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  50.43 
 
 		 131 aa  100  5e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  52.5 
 
 		 122 aa  100  8e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  49.12 
 
 		 125 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  50.82 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  48.72 
 
 		 125 aa  97.1  7e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  48.18 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  50.81 
 
 		 124 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  47.37 
 
 		 125 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  49.07 
 
 		 128 aa  90.5  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  46.77 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  43.97 
 
 		 124 aa  89.4  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  46.34 
 
 		 130 aa  88.6  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  40.65 
 
 		 126 aa  89.4  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  45.3 
 
 		 128 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  48.31 
 
 		 134 aa  87.8  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  45.38 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  45.38 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  45.79 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  56.41 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  46.61 
 
 		 126 aa  85.9  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  51.4 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  48.96 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  41.6 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  46.34 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  40.98 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  47.47 
 
 		 133 aa  72.8  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  45.19 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  37.4 
 
 		 151 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  39.2 
 
 		 138 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  45.28 
 
 		 154 aa  70.5  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  43.97 
 
 		 136 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  41.94 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  38.02 
 
 		 121 aa  69.3  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  35.77 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  36.13 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  35.29 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  50 
 
 		 109 aa  67.4  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  41.11 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  41.11 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  35.29 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  45.63 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  37.27 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  41.11 
 
 		 126 aa  66.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  32.28 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  32.28 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  32.28 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  31.5 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  33.62 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  40.7 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  32 
 
 		 134 aa  65.5  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  38.74 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  44.44 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  43.43 
 
 		 140 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  38.37 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 137 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  38.26 
 
 		 118 aa  64.3  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  36.7 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  35.83 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  42.74 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  39.45 
 
 		 129 aa  63.5  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 		 129 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  36.84 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  35.25 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1311  CrcB protein  50.5 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  31.09 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  35.45 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 128 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  35.11 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  33.67 
 
 		 130 aa  62  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  33.91 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  47.37 
 
 		 127 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  39.8 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  37.93 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  34.58 
 
 		 118 aa  61.6  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  37.5 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>