More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_1657 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
128 aa  245  1e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  46.34 
 
 
124 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 
128 aa  108  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  45.38 
 
 
124 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  51.64 
 
 
134 aa  107  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
126 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  48.76 
 
 
128 aa  102  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  48.03 
 
 
132 aa  101  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  41.46 
 
 
131 aa  97.4  5e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
124 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  45.24 
 
 
125 aa  94.4  5e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  47.97 
 
 
125 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  45.16 
 
 
124 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  52.85 
 
 
125 aa  92.8  2e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  47.15 
 
 
125 aa  91.3  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1764  camphor resistance protein CrcB  54.33 
 
 
147 aa  90.9  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.342107 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  45.53 
 
 
124 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  46.36 
 
 
127 aa  89.7  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  45.53 
 
 
124 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  44.8 
 
 
126 aa  89  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  45.24 
 
 
125 aa  89.4  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  44.35 
 
 
124 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 
124 aa  87.8  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  42.24 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  39.67 
 
 
128 aa  86.7  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  37.01 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  45.97 
 
 
126 aa  85.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  40.83 
 
 
122 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  40.16 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  49.47 
 
 
126 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  42.28 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  49.47 
 
 
126 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  37.8 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 
137 aa  80.1  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  42.86 
 
 
128 aa  79.3  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  51.22 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  40 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  42.5 
 
 
136 aa  79  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  37.7 
 
 
143 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  36 
 
 
124 aa  77  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  35.43 
 
 
128 aa  77  0.00000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  35.77 
 
 
124 aa  77  0.00000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 
126 aa  76.6  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  41.24 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  39.66 
 
 
121 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  43.36 
 
 
154 aa  74.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  42.64 
 
 
129 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  38.4 
 
 
131 aa  73.9  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  35.59 
 
 
127 aa  73.9  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  41.13 
 
 
133 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  38.32 
 
 
107 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  39.45 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  38.4 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  41.8 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  39.68 
 
 
142 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  41.96 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  33.88 
 
 
151 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  42.27 
 
 
128 aa  72  0.000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
129 aa  72  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  41.94 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  34.96 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  36.07 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  34.62 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  34.62 
 
 
130 aa  70.9  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  31.93 
 
 
118 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  36.07 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  31.93 
 
 
118 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  31.93 
 
 
118 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1662  camphor resistance protein CrcB  33.07 
 
 
124 aa  70.1  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111421  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  41.6 
 
 
130 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
113 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  32.77 
 
 
118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  42.2 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  31.93 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  36.19 
 
 
120 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  34.62 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0708  camphor resistance protein CrcB  43.01 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>