More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_2768 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  100 
 
 
133 aa  252  9e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  60.16 
 
 
124 aa  133  8e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  60 
 
 
121 aa  130  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  45.53 
 
 
128 aa  92.8  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  43.51 
 
 
140 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  38.84 
 
 
126 aa  87.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  44.64 
 
 
125 aa  87  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  38.84 
 
 
126 aa  86.7  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  44.83 
 
 
125 aa  86.7  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
124 aa  86.7  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  49.57 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
128 aa  84.7  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  44.8 
 
 
136 aa  83.6  9e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  49.5 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  44.54 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  41.49 
 
 
126 aa  82  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  36.07 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  48.96 
 
 
122 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  40.16 
 
 
125 aa  81.6  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  49.5 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  40.94 
 
 
130 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  44.33 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  44.33 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  44.33 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  45.3 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  43.43 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  43.43 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  44.79 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  38.84 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  43.43 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  43.43 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  47.47 
 
 
133 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  38.14 
 
 
118 aa  79.7  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  51.11 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  47.42 
 
 
122 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  42.27 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  43.16 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  42.24 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  44.33 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  46 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  40.16 
 
 
162 aa  78.2  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  41.74 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  41 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  42.73 
 
 
129 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  40.52 
 
 
122 aa  76.6  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  42.4 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  46.15 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  41 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  46.73 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  44.57 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  41.74 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  42.11 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  40.98 
 
 
129 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  42.42 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  34.75 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  44.83 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  39.84 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  41.07 
 
 
122 aa  73.6  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0797  camphor resistance protein CrcB  44.9 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  39.47 
 
 
131 aa  72.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  43.22 
 
 
151 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  43.3 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  45.19 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  43.02 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  46.15 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  46.15 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  41.23 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  43.86 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  42.34 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  42.39 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  39.82 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  42.42 
 
 
123 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  42.55 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  40.78 
 
 
120 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  41.96 
 
 
132 aa  72  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
132 aa  72  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  39.29 
 
 
119 aa  71.2  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  48.24 
 
 
107 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  47.78 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  40.98 
 
 
127 aa  71.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  41.6 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  35.54 
 
 
143 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  37.01 
 
 
129 aa  70.9  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0708  camphor resistance protein CrcB  43.88 
 
 
133 aa  70.9  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  39.2 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  45.38 
 
 
138 aa  70.5  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  47.67 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  40.32 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>