More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3016 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 124 aa  241  3e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  75.81 
 
 		 140 aa  186  1e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  70.97 
 
 		 124 aa  177  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  67.74 
 
 		 129 aa  172  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  68.55 
 
 		 124 aa  168  2e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  66.94 
 
 		 125 aa  168  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  67.74 
 
 		 124 aa  166  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  56.1 
 
 		 123 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  45.16 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  44.92 
 
 		 132 aa  99.4  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  44.26 
 
 		 193 aa  97.1  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  44.86 
 
 		 228 aa  96.7  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  48.21 
 
 		 124 aa  95.1  2e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  41.53 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  44.14 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  44.55 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  44.14 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  47.06 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  42.62 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  47.32 
 
 		 129 aa  89.4  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 124 aa  88.6  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 124 aa  88.6  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 124 aa  88.6  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  41.13 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  43.24 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  46.22 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  46.22 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  45.61 
 
 		 126 aa  87.4  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  41.13 
 
 		 125 aa  87.4  6e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 132 aa  87.4  6e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 		 126 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  44.44 
 
 		 133 aa  86.7  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  46.36 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  47.27 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  41.38 
 
 		 127 aa  85.5  2e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  37.9 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  49.12 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  46.22 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  41.23 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  41.32 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 		 122 aa  83.6  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  40.52 
 
 		 125 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  46.55 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  43.24 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  45.22 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  43.24 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  35.25 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  43.44 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  40.2 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  40.2 
 
 		 130 aa  81.6  0.000000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  43.75 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  42.5 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  41.82 
 
 		 121 aa  81.3  0.000000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 124 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  39.02 
 
 		 143 aa  81.3  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 		 129 aa  80.1  0.000000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  36.67 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  42.24 
 
 		 128 aa  80.1  0.000000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  38.84 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  43.75 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 		 127 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  42.98 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  37.38 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  39.22 
 
 		 130 aa  77.8  0.00000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  41.84 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  44.04 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  42 
 
 		 123 aa  76.6  0.00000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  32.38 
 
 		 123 aa  77  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  43.81 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  35.85 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  36.8 
 
 		 142 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  41.28 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 133 aa  73.9  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 		 134 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  37.5 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>