More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1273 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  100 
 
 		 130 aa  253  8e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  89.23 
 
 		 130 aa  209  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  89.23 
 
 		 130 aa  209  1e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  42.19 
 
 		 133 aa  95.1  3e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  44.35 
 
 		 126 aa  92.8  1e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  44.17 
 
 		 128 aa  92.4  2e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 		 125 aa  92  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 140 aa  90.9  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  46.28 
 
 		 122 aa  90.5  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 		 124 aa  90.9  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 125 aa  90.5  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 124 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 124 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 124 aa  89.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  45.61 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 		 124 aa  89.4  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  43.44 
 
 		 123 aa  88.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 124 aa  87.4  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  38.66 
 
 		 132 aa  86.3  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 		 128 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  40 
 
 		 134 aa  85.9  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 		 134 aa  84.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  42.98 
 
 		 130 aa  84  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  42.28 
 
 		 129 aa  84  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  39.52 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  38.6 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 		 118 aa  81.6  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  39.34 
 
 		 121 aa  81.6  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 132 aa  81.3  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  43.33 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  41.94 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 		 118 aa  80.5  0.000000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 128 aa  80.5  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 		 118 aa  79.7  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 		 118 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  37.07 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  36.28 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  34.92 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  35.54 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  42.34 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  41.44 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  37.29 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  38.18 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  37.93 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  35.71 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  34.38 
 
 		 132 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  40.52 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  42.15 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  39.17 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  41.32 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  38.89 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 119 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 128 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  35.65 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  41.05 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  41.05 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  36.29 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  41.05 
 
 		 126 aa  72  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  33.88 
 
 		 151 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  42.45 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  43.7 
 
 		 122 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  43.62 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  39.25 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  40.74 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  40.74 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  42.37 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  33.61 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  40.78 
 
 		 228 aa  70.5  0.000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  36.94 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 140 aa  70.5  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  38.4 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  33.33 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  37.62 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>