More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3981 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  100 
 
 
127 aa  247  4e-65  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  42.86 
 
 
125 aa  88.2  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  42.02 
 
 
123 aa  84.7  4e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  40.65 
 
 
126 aa  83.6  8e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  40.65 
 
 
126 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  36.75 
 
 
127 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  40.19 
 
 
122 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  35.9 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 
133 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 
127 aa  76.3  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  35.9 
 
 
127 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  38.6 
 
 
143 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  35.83 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  32.52 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  32.52 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  34.15 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  36.29 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  32.52 
 
 
124 aa  70.1  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 
124 aa  70.1  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  37.61 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  35.9 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 
131 aa  68.9  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  39.39 
 
 
127 aa  68.6  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  33.62 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  32.48 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 
126 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  40.21 
 
 
127 aa  67  0.00000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  40.5 
 
 
126 aa  67.4  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0776  camphor resistance protein CrcB  33.87 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0583654  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 
124 aa  67  0.00000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 
123 aa  67  0.00000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  33.87 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  33.87 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  33.87 
 
 
127 aa  66.6  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  35.54 
 
 
117 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  31.71 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  31.93 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  34.43 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  34.62 
 
 
125 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  33.88 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1662  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 
124 aa  65.5  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111421  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  37.27 
 
 
140 aa  65.1  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  30.89 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0397  CrcB protein  35.96 
 
 
166 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.302556  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  34.58 
 
 
122 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  34.86 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 
122 aa  62.8  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  37.3 
 
 
129 aa  62.8  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 
126 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 
129 aa  63.5  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  32.8 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  32.5 
 
 
123 aa  62  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
129 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  32.54 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  37.74 
 
 
129 aa  62.8  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  33.85 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 
128 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  36 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  37.19 
 
 
123 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  37.3 
 
 
144 aa  61.6  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  36.29 
 
 
130 aa  61.6  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 
124 aa  61.2  0.000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 
128 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  33.64 
 
 
130 aa  61.2  0.000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 
128 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  35.16 
 
 
137 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 
134 aa  60.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  32.77 
 
 
122 aa  60.1  0.000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 
130 aa  60.1  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>