More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1914 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  100 
 
 		 129 aa  251  3e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  49.22 
 
 		 136 aa  88.2  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  44.35 
 
 		 131 aa  87  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  53.68 
 
 		 121 aa  87  8e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  44.26 
 
 		 132 aa  85.9  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 		 131 aa  81.6  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  44 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  43.2 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  45.53 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  43.8 
 
 		 131 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 134 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  41.6 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  44.76 
 
 		 132 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0802663 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  42.86 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  40 
 
 		 142 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  40.34 
 
 		 143 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  40.94 
 
 		 270 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  40.62 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  41.32 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  41.07 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  39.2 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 140 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  42.15 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  35.25 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  40.48 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  38.4 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  37.07 
 
 		 122 aa  69.3  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  41.44 
 
 		 107 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  37.14 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  37.14 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  45.1 
 
 		 228 aa  67  0.00000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1528  camphor resistance protein CrcB  44.9 
 
 		 133 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  33.86 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  40 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  37.14 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 123 aa  65.1  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  44.17 
 
 		 131 aa  64.3  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  33.88 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  39.1 
 
 		 134 aa  64.3  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  39.52 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  41.3 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  34.71 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  38.35 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  37.88 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  31.2 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  33.59 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  34.88 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  42.64 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  41.84 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  39.84 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  34.85 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  34.88 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  34.48 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  35.88 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  35.88 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  36.22 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  35.88 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  35.88 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  35.88 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  40 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  39.81 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0519  Camphor resistance CrcB protein  41.53 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  41.84 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  38.17 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  38.14 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  47.13 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  46.3 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  33.33 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  36 
 
 		 131 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  35.61 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  39.66 
 
 		 123 aa  60.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  41.11 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  44.14 
 
 		 137 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  37.12 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  38.6 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1527  Camphor resistance CrcB protein  39.52 
 
 		 147 aa  60.1  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  45.37 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  37.21 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  37.21 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  46.24 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  35.54 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2422  hypothetical protein  44.44 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  34.55 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  30.83 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  44.9 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  43.75 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  38.14 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  43.75 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>