More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2709 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 125 aa  238  2e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  49.19 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  47.2 
 
 		 125 aa  100  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  47.2 
 
 		 125 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  49.18 
 
 		 125 aa  98.6  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  51.24 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 		 124 aa  95.9  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  52.85 
 
 		 128 aa  94  7e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  41.94 
 
 		 125 aa  93.6  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  44.63 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  40.16 
 
 		 131 aa  90.5  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 128 aa  88.2  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  43.8 
 
 		 134 aa  87.4  5e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  46.3 
 
 		 127 aa  87  8e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  42.15 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  46.72 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  46.72 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  45.45 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  44.55 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  37.01 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 124 aa  83.6  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  45.24 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  41.12 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  43.52 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  40.5 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  45.9 
 
 		 137 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  46.67 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  46.79 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  42.62 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  40.83 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  37.9 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  47.37 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  46.32 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  41.8 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  36.8 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  44.76 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1434  camphor resistance protein CrcB  46.67 
 
 		 126 aa  74.3  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  49 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  37.1 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  44.57 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  43.43 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  37.96 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  35.4 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0797  camphor resistance protein CrcB  46.51 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  41.53 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 		 140 aa  72  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  35.43 
 
 		 132 aa  72  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  37.96 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 		 134 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  42.99 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 		 113 aa  72  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  43.62 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  40.4 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  33.87 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  33.87 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  42.31 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0708  camphor resistance protein CrcB  45.35 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  39.39 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  42.86 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  35.85 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  45.65 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  37.7 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  37.04 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  35.2 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  34.38 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  39.64 
 
 		 126 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  47.46 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  39.42 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  36.59 
 
 		 124 aa  66.6  0.00000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1099  crcB protein  40.35 
 
 		 120 aa  66.6  0.00000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.236283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  31.45 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  33.96 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  33.96 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  38.58 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  37.17 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  36.67 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  33.88 
 
 		 151 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  31.75 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  37.78 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>