More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1023 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 124 aa  241  1.9999999999999999e-63  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  42.71 
 
 		 126 aa  97.1  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  42.31 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  40.83 
 
 		 123 aa  92.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 124 aa  88.6  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 128 aa  88.2  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 134 aa  84.7  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 134 aa  84.3  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 		 128 aa  83.6  9e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  37.4 
 
 		 133 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  37.1 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 128 aa  82  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  38.71 
 
 		 126 aa  82  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  46.73 
 
 		 122 aa  82.4  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0182  CrcB protein  40.5 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.453198  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  41.32 
 
 		 127 aa  81.3  0.000000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  40.74 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 		 137 aa  80.9  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  43.62 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  41.32 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  39.81 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  35.25 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  37.7 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  42.55 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  45.79 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  34.68 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  38.14 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  37.93 
 
 		 193 aa  77.4  0.00000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  31.45 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  34.68 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  38.52 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  40.95 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 126 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  36.89 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  38.14 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  44.86 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  37.63 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  38.21 
 
 		 125 aa  75.1  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  36.97 
 
 		 143 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 		 122 aa  74.7  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  37.5 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  37.19 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  36.67 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  37.98 
 
 		 131 aa  72.8  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  33.64 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  35 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  39.56 
 
 		 228 aa  72  0.000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  38.6 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  33.87 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  36.29 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  36.97 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  33.87 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  38.24 
 
 		 136 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2721  Camphor resistance CrcB protein  37.9 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.186875 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0015  camphor resistance CrcB protein  40.74 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  33.65 
 
 		 132 aa  70.5  0.000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 131 aa  70.1  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  36.29 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  34.74 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  38.32 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  34.4 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  38.32 
 
 		 130 aa  69.7  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  38.1 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  40.21 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  39.2 
 
 		 125 aa  70.1  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  36.45 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  32.23 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  35.83 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  33.33 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>