More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_0702 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 124 aa  241  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  97.58 
 
 		 124 aa  236  8e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  70.97 
 
 		 124 aa  179  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  68.55 
 
 		 124 aa  168  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  64.52 
 
 		 129 aa  160  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  58.06 
 
 		 125 aa  147  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  59.68 
 
 		 140 aa  144  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  55.74 
 
 		 123 aa  122  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 123 aa  103  1e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  47.86 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  47.01 
 
 		 124 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  47.01 
 
 		 124 aa  100  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  45.76 
 
 		 128 aa  99.8  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 		 124 aa  99.8  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  45.3 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  45.3 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  45.3 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  47.01 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 124 aa  97.1  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  45.79 
 
 		 228 aa  96.3  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  41.67 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  43.65 
 
 		 132 aa  95.1  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  43.22 
 
 		 127 aa  94.4  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  93.6  7e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  41.94 
 
 		 126 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  40.16 
 
 		 193 aa  92  2e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  46.6 
 
 		 124 aa  90.5  6e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  39.67 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  43.64 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  44.55 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  42.86 
 
 		 124 aa  86.7  9e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  41.96 
 
 		 127 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  42.34 
 
 		 133 aa  85.5  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  34.43 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  39.66 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  44.25 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  35.43 
 
 		 130 aa  84.7  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  43.52 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  36.04 
 
 		 126 aa  84  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 		 124 aa  83.6  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  39.84 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  44.83 
 
 		 128 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  37.9 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  37.9 
 
 		 125 aa  82  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  41.96 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  41.96 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  41.96 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  39.52 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  40.35 
 
 		 123 aa  81.6  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  40.91 
 
 		 127 aa  80.1  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  37.1 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  43 
 
 		 123 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  38.71 
 
 		 125 aa  79.3  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  42.97 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  38.32 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  38.32 
 
 		 130 aa  78.6  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  37.07 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  36.19 
 
 		 123 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 126 aa  78.2  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  41 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  42.31 
 
 		 127 aa  77.8  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  41 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  34.43 
 
 		 122 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  36.89 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  42.99 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  38.39 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  33.61 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  37.9 
 
 		 132 aa  77  0.00000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  43.69 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  32.26 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  42.31 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  39.66 
 
 		 151 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  38.52 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  40.83 
 
 		 138 aa  75.9  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  42.06 
 
 		 130 aa  74.7  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  36.13 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  37.19 
 
 		 121 aa  74.7  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  34.68 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 131 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>