280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2949 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 131 aa  254  2e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  69.6 
 
 		 131 aa  170  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  55.66 
 
 		 127 aa  99.4  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  45.87 
 
 		 131 aa  97.4  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3455  hypothetical protein  55.74 
 
 		 134 aa  96.7  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0794685 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  47.93 
 
 		 132 aa  95.9  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0767  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0817  camphor resistance protein CrcB  44.17 
 
 		 133 aa  92.8  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  44.35 
 
 		 129 aa  87  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  49.04 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0802663 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  44.55 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  39.17 
 
 		 143 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1528  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 		 133 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  40.83 
 
 		 140 aa  73.9  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1915  camphor resistance CrcB protein  50.45 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  36.7 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  36.13 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  41.6 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  39.81 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  36.44 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  40.57 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  38.79 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  40.37 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  41.03 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  36.44 
 
 		 142 aa  65.1  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  42.48 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  40.91 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1705  camphor resistance protein CrcB  43.3 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.439733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1726  camphor resistance protein CrcB  43.3 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390314  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1773  camphor resistance protein CrcB  43.3 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  44.57 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  38.24 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  32.48 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  34.92 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  32.08 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  41.23 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  35.54 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  32.08 
 
 		 130 aa  63.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  40.74 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  36.19 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  34.58 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  37.38 
 
 		 138 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  37.74 
 
 		 228 aa  61.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  36.45 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  43.96 
 
 		 133 aa  60.8  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  38.98 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  37.61 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  44 
 
 		 140 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  33.96 
 
 		 130 aa  60.8  0.000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  26.89 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  35.96 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  35.96 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  36.94 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 119 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 133 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  37.23 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  38.78 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  37.23 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  37.9 
 
 		 270 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4408  camphor resistance protein CrcB  39.05 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  35.34 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0908  CrcB protein  42.5 
 
 		 129 aa  58.2  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.862739  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  35.14 
 
 		 126 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 128 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  35.14 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  39.05 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  34.51 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  30.43 
 
 		 151 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  36.08 
 
 		 132 aa  57  0.00000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  34.78 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  33.33 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  38.53 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13087  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 126 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3757  normal  0.719495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>