More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_1528 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1528  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 133 aa  249  9.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  80.15 
 
 		 132 aa  176  7e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0802663 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0767  camphor resistance protein CrcB  52.46 
 
 		 133 aa  119  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0817  camphor resistance protein CrcB  51.64 
 
 		 133 aa  117  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  48.28 
 
 		 132 aa  97.8  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  48.33 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  44.72 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3455  hypothetical protein  50.43 
 
 		 134 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0794685 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  45.61 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 		 123 aa  79  0.00000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  41.74 
 
 		 142 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  45.54 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  39.23 
 
 		 142 aa  76.3  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  43.1 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  42.52 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  42.06 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  38.05 
 
 		 130 aa  72  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  35.25 
 
 		 123 aa  71.2  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  45.3 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  40 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  45.3 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 126 aa  70.5  0.000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  38.46 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  40.17 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  41.18 
 
 		 270 aa  68.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  38.46 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  39.84 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  38.84 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  38.53 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  45.92 
 
 		 114 aa  67.4  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  37.39 
 
 		 117 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  42.61 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  38.98 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  41.44 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  40 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  39.45 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  35.29 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  39.09 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  45.35 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  41.51 
 
 		 133 aa  63.9  0.0000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  30.47 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  42.31 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  34.58 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  38.53 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  32.17 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  37.5 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  31.93 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  42.74 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  38.84 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  40.78 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  42.53 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 119 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  33.91 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  38.53 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  33.88 
 
 		 151 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  33.04 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  35.29 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  38.46 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2660  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28327  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  35.83 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  38.98 
 
 		 130 aa  58.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  36.67 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  34.88 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  33.05 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  40.78 
 
 		 228 aa  58.5  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  37.63 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  37.63 
 
 		 134 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  35.4 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  37.74 
 
 		 125 aa  58.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  40.86 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  37.17 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  40.4 
 
 		 117 aa  58.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>