More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2292 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2292  CrcB protein  100 
 
 
117 aa  214  4e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  43.55 
 
 
130 aa  89  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  47.93 
 
 
128 aa  85.9  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  38.79 
 
 
118 aa  83.6  7e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  43.97 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  45.61 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  45.61 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  45.61 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  45.61 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  45.61 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  45.61 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  45.61 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  45.61 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  43.86 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1007  CrcB protein  40.8 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.83695  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  41.46 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  40.98 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  40.98 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 
123 aa  75.1  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  42.39 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  47.15 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0493  camphor resistance protein CrcB  43.88 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  46.34 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  41.44 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
124 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  37.4 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  40.98 
 
 
129 aa  73.6  0.0000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  42.37 
 
 
127 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 
132 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  40.87 
 
 
132 aa  71.2  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  38.71 
 
 
125 aa  71.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  40.22 
 
 
125 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 
131 aa  70.9  0.000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  44.07 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  37.9 
 
 
125 aa  70.5  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  44.83 
 
 
133 aa  70.1  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  37.3 
 
 
124 aa  70.1  0.000000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  31.97 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  38.33 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  41.07 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  37.07 
 
 
143 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  42.73 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  38.04 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  42.73 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  35.04 
 
 
132 aa  68.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  39.64 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  40.22 
 
 
193 aa  67.4  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 
128 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  40.86 
 
 
228 aa  67  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  32.79 
 
 
124 aa  67  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  40.87 
 
 
125 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  41.07 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  46.67 
 
 
126 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  40.43 
 
 
124 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 
124 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 
126 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
122 aa  66.2  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
129 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  47.73 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  43.86 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  35.54 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  39.67 
 
 
128 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  38.33 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
122 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  38.79 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  39.66 
 
 
126 aa  64.7  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  38.79 
 
 
125 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  38.04 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  36.13 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  37.82 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  40.62 
 
 
139 aa  64.3  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3446  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500198  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  37.9 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  45.74 
 
 
127 aa  62.8  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1099  crcB protein  38.05 
 
 
120 aa  62.8  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.236283  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  33.87 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 
119 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 
125 aa  62.8  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 
129 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  36.36 
 
 
127 aa  62  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  40.87 
 
 
133 aa  62  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  34.51 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  34.21 
 
 
116 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  38.14 
 
 
142 aa  62.4  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  38.04 
 
 
118 aa  62.8  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  38.26 
 
 
133 aa  62  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  32.2 
 
 
126 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  33.05 
 
 
129 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  44.83 
 
 
125 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  35 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  36.07 
 
 
124 aa  61.6  0.000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  41.05 
 
 
128 aa  61.2  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  42.27 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1562  crcB protein  39.62 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>