More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2843 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
130 aa  241  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  86.36 
 
 
124 aa  184  3e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  47.58 
 
 
125 aa  102  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  46.77 
 
 
125 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
124 aa  91.7  3e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 
128 aa  91.3  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1434  camphor resistance protein CrcB  52.34 
 
 
126 aa  90.5  7e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  46.34 
 
 
133 aa  88.6  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  41.09 
 
 
162 aa  88.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  36.51 
 
 
128 aa  87  7e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  44.25 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  40.98 
 
 
125 aa  84.3  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  48.51 
 
 
137 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  46.22 
 
 
123 aa  84  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  41.53 
 
 
123 aa  83.6  9e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  45.45 
 
 
121 aa  83.6  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  39.17 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 
134 aa  82  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 
134 aa  82  0.000000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  38.98 
 
 
125 aa  82  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  43.97 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  42.37 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  45.45 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  39.34 
 
 
132 aa  80.9  0.000000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 
119 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  39.17 
 
 
128 aa  80.1  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 
128 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  41.94 
 
 
123 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  40 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  41.84 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 
124 aa  79  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  38.71 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  42.24 
 
 
116 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  45.22 
 
 
124 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  42.15 
 
 
126 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  38.46 
 
 
151 aa  77.4  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  43.3 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 
124 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  45.74 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  47.12 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  41.32 
 
 
122 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  38.76 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  37.14 
 
 
122 aa  75.1  0.0000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  43.16 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  42.15 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  37.01 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 
126 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  38.1 
 
 
130 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 
124 aa  73.9  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  44.68 
 
 
133 aa  73.6  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  44.57 
 
 
124 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  37.61 
 
 
193 aa  73.2  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  41.94 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  35.29 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  39.52 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  43.93 
 
 
124 aa  72.8  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  44.04 
 
 
128 aa  72  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  36 
 
 
125 aa  72.4  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  39.68 
 
 
130 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 
129 aa  71.6  0.000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2422  hypothetical protein  42.11 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  43.62 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  42.27 
 
 
126 aa  72  0.000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 
131 aa  71.2  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  40.95 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  46.74 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  36.84 
 
 
123 aa  70.5  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  34.43 
 
 
132 aa  70.5  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  39.77 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  35.71 
 
 
131 aa  70.5  0.000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  39.77 
 
 
126 aa  70.1  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0797  camphor resistance protein CrcB  40.82 
 
 
133 aa  70.1  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  42.37 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1988  camphor resistance protein CrcB  44.21 
 
 
126 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227599  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  39.77 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 
125 aa  70.1  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  38.32 
 
 
127 aa  70.1  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 
129 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 
126 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  43.56 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>