More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_1535 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  100 
 
 		 124 aa  239  1e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  54.63 
 
 		 124 aa  119  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  45.97 
 
 		 124 aa  107  6e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  40.65 
 
 		 125 aa  103  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0461  Camphor resistance CrcB protein  52 
 
 		 124 aa  94.4  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.32096 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  44.26 
 
 		 126 aa  87.8  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  40.98 
 
 		 116 aa  85.9  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  44.83 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  42.71 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 122 aa  81.3  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  45.3 
 
 		 133 aa  80.9  0.000000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 122 aa  80.9  0.000000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  42.15 
 
 		 122 aa  80.5  0.000000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  42.74 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 124 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  41.12 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 128 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  42 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  42 
 
 		 126 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  42.06 
 
 		 130 aa  75.5  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 134 aa  73.2  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  42.34 
 
 		 137 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  41.07 
 
 		 119 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  35.14 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  36.28 
 
 		 129 aa  71.6  0.000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  38.05 
 
 		 129 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 		 118 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  34.23 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  33.33 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  34.23 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 		 118 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  36.84 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1434  camphor resistance protein CrcB  47 
 
 		 126 aa  70.1  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  35.14 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 		 118 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  35.25 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  39.83 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  35.25 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 129 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1465  CrcB protein  40 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  32.77 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  35.77 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  34.23 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  40.57 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  34.23 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  35.77 
 
 		 133 aa  67.4  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  33.87 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 		 118 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  38.02 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 		 125 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  41.3 
 
 		 130 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  37.25 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  35.71 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 		 140 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 		 125 aa  65.9  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  34.02 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  35.14 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  44.09 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  36.44 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  32.48 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  32.5 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  40.68 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  31.45 
 
 		 132 aa  64.3  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  40.19 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>