259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2422 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2422  hypothetical protein  100 
 
 		 134 aa  249  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 131 aa  73.6  0.0000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  46.77 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  45.76 
 
 		 142 aa  72.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 132 aa  73.2  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 125 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  44 
 
 		 121 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  41.73 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  39.85 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  40.48 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  49.41 
 
 		 228 aa  67  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 		 134 aa  67.4  0.00000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  35.48 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0818  camphor resistance protein CrcB  42.97 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.682767  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  42.28 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  45.95 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0768  camphor resistance protein CrcB  42.97 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  39.67 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  40 
 
 		 143 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  40.98 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  41.75 
 
 		 130 aa  62  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  40.78 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  39.83 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 128 aa  61.6  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  42.52 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  30.83 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  42.74 
 
 		 270 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 		 162 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  44.14 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  37.29 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  44.44 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1311  CrcB protein  53.12 
 
 		 127 aa  59.3  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 124 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  32.69 
 
 		 124 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  33.88 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  46.46 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  36.15 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  38.68 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  40 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  38.68 
 
 		 126 aa  57.4  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  33.88 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  33.88 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  46.81 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  33.88 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  37.9 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  33.05 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  33.33 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  33.88 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  44.44 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  42.55 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  38.54 
 
 		 117 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3962  CrcB protein  46.15 
 
 		 118 aa  55.5  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  37.25 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  37.19 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  40.16 
 
 		 126 aa  55.5  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  44.79 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  30.89 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0201  camphor resistance CrcB protein  35.94 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  41.32 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  37.6 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  33.88 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  38.39 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  38.39 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  33.05 
 
 		 127 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  37.38 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  39.17 
 
 		 129 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  33.91 
 
 		 127 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  33.62 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  27.2 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  33.05 
 
 		 122 aa  52.8  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  33.05 
 
 		 122 aa  51.6  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  37.3 
 
 		 134 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1099  crcB protein  35.71 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.236283  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  35.59 
 
 		 124 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 		 122 aa  52  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>