More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2493 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 124 aa  232  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  86.36 
 
 		 130 aa  185  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1434  camphor resistance protein CrcB  55.83 
 
 		 126 aa  96.7  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  45.76 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  44.26 
 
 		 128 aa  94.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  45.76 
 
 		 125 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  45.08 
 
 		 162 aa  94.4  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 128 aa  90.1  9e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 		 137 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  41.67 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  46.9 
 
 		 132 aa  89.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  47.79 
 
 		 133 aa  89.4  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  45.13 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  43.97 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 124 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 124 aa  87.4  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 134 aa  87  8e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  40.16 
 
 		 125 aa  86.7  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 134 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  43.97 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  39.67 
 
 		 123 aa  86.3  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  45.97 
 
 		 123 aa  86.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  47.27 
 
 		 121 aa  85.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 		 124 aa  85.9  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  40.52 
 
 		 123 aa  84.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  44.25 
 
 		 124 aa  84.7  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  41.74 
 
 		 128 aa  84.7  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  46.36 
 
 		 124 aa  84.3  4e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  43.97 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  44.63 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  41.88 
 
 		 193 aa  83.6  7e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  42.24 
 
 		 124 aa  83.6  8e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  43.44 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  40.98 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  38.84 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  42.02 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  38.1 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  41.94 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0513  CrcB protein  40.16 
 
 		 125 aa  80.5  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  39.34 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 		 124 aa  80.5  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  39.66 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  45.22 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  36.44 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 		 126 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  34.96 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  38.52 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0797  camphor resistance protein CrcB  42.57 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 134 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  41.59 
 
 		 126 aa  76.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  39.18 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 129 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0708  camphor resistance protein CrcB  41.58 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  48 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  37.04 
 
 		 134 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  41.58 
 
 		 131 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  39.22 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  37.7 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  39.66 
 
 		 116 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  40.16 
 
 		 151 aa  74.3  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  45.45 
 
 		 140 aa  74.3  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  35.2 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  40.54 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  45.26 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  42.39 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2422  hypothetical protein  41.23 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  33.88 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  45.63 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  43.33 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 129 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  47 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  33.88 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  38.04 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  34.15 
 
 		 130 aa  72  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  38.04 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  40.98 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  37.62 
 
 		 130 aa  70.9  0.000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  38.46 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  40.54 
 
 		 118 aa  70.5  0.000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>