More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00367 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 127 aa  248  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  91.34 
 
 		 127 aa  233  5.0000000000000005e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  77.6 
 
 		 126 aa  197  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  70.97 
 
 		 126 aa  177  4.999999999999999e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  52.07 
 
 		 128 aa  123  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  51.67 
 
 		 127 aa  122  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  52.59 
 
 		 124 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  51.72 
 
 		 124 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  51.67 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  49.14 
 
 		 124 aa  103  8e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  44.63 
 
 		 127 aa  103  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  49.14 
 
 		 124 aa  101  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  48.25 
 
 		 123 aa  101  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 		 124 aa  101  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 		 124 aa  100  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 		 124 aa  100  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  47.83 
 
 		 124 aa  100  8e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  46.96 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  46.96 
 
 		 124 aa  99.4  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  47.37 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  47.37 
 
 		 124 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  46.96 
 
 		 124 aa  98.2  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  47.41 
 
 		 124 aa  97.8  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  46.96 
 
 		 124 aa  96.7  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  45.54 
 
 		 122 aa  96.3  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  48.28 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  44.14 
 
 		 124 aa  92.8  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  53.93 
 
 		 124 aa  90.9  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  46.43 
 
 		 140 aa  88.6  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  44.34 
 
 		 228 aa  88.2  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  43.59 
 
 		 124 aa  88.2  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 124 aa  87.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  41.96 
 
 		 124 aa  86.3  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  44.64 
 
 		 124 aa  86.7  1e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  40.54 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  39.64 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  44.8 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  44 
 
 		 122 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  41.07 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  41.44 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  35.71 
 
 		 136 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  41.44 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  38.98 
 
 		 132 aa  77.4  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 		 129 aa  77  0.00000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  45.63 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  43.36 
 
 		 122 aa  76.3  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  39.62 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  38.46 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  50.62 
 
 		 99 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  40.5 
 
 		 131 aa  75.5  0.0000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  42.16 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  37.39 
 
 		 116 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 133 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  34.78 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  43.24 
 
 		 122 aa  73.9  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  37.84 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 		 128 aa  73.6  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  37.61 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  41.75 
 
 		 122 aa  72.8  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  42.16 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  42.16 
 
 		 130 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  43.27 
 
 		 118 aa  71.6  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  39.83 
 
 		 193 aa  71.6  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  38.6 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 		 127 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  38.79 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0590  CrcB protein  35.96 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000337717  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  40.34 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  40.5 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  40.34 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  44.32 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  44.32 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  39.13 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  34.23 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  37.93 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  35.9 
 
 		 125 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  34.21 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  38.14 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  37.93 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>