More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2396 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  100 
 
 		 124 aa  243  8e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  56.1 
 
 		 125 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  62.26 
 
 		 124 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  45.97 
 
 		 124 aa  107  6e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  46.77 
 
 		 126 aa  104  3e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  42.62 
 
 		 123 aa  93.6  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  47.57 
 
 		 140 aa  92  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  48.54 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  47.57 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  46.6 
 
 		 124 aa  90.5  6e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  42.62 
 
 		 124 aa  89.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0461  Camphor resistance CrcB protein  56 
 
 		 124 aa  87  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.32096 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  40.65 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  42.86 
 
 		 228 aa  85.5  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  40.87 
 
 		 129 aa  84.3  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 		 125 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  40.52 
 
 		 132 aa  83.2  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  46.08 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 132 aa  82  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  41.38 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 127 aa  81.6  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  40.74 
 
 		 124 aa  80.1  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  40.52 
 
 		 121 aa  79.7  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 125 aa  78.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  38.26 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  39.42 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  39.42 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  39.42 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  39.42 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  42.53 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 130 aa  77.4  0.00000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  42.99 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  36.89 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  39.42 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  39.42 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  45 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 132 aa  76.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 		 129 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  39.42 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  39.42 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 		 133 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0908  CrcB protein  51.28 
 
 		 129 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.862739  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  40.19 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 162 aa  74.3  0.0000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  37.61 
 
 		 123 aa  74.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 124 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  43.1 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  44.83 
 
 		 133 aa  73.6  0.0000000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  35.83 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  38.46 
 
 		 151 aa  73.6  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  34.68 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  45.54 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 		 127 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  38.66 
 
 		 128 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  34.75 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  39.67 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  41.75 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  35.92 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  42.72 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  41.24 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  38.02 
 
 		 126 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  42.72 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  38.02 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  42.72 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  38.98 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  40.21 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  40.21 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  36.04 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0818  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  37.36 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  33.33 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  38.33 
 
 		 138 aa  67  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  35.54 
 
 		 130 aa  66.6  0.00000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  37.36 
 
 		 137 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  37.37 
 
 		 129 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  38.95 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  32.71 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  35.29 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  32.71 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1465  CrcB protein  38.1 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  39.25 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  33.63 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  36.97 
 
 		 136 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  34.45 
 
 		 142 aa  64.7  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  36.26 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  39.32 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  38.3 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  40.62 
 
 		 130 aa  63.9  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>