More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2802 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 127 aa  242  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  73.77 
 
 		 129 aa  181  3e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  67.72 
 
 		 129 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  72.73 
 
 		 130 aa  171  2.9999999999999996e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  66.13 
 
 		 129 aa  168  2e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  60.8 
 
 		 128 aa  134  3.0000000000000003e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0191  camphor resistance protein CrcB  57.94 
 
 		 128 aa  122  2e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  40.52 
 
 		 134 aa  87  7e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 128 aa  86.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 122 aa  85.5  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  44.66 
 
 		 122 aa  85.9  2e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  43.1 
 
 		 122 aa  85.1  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 122 aa  84.7  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 		 140 aa  84.3  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  47.57 
 
 		 125 aa  84  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  46.6 
 
 		 125 aa  84  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  42.86 
 
 		 131 aa  82.4  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  40 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  41.32 
 
 		 128 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  41.67 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  40.18 
 
 		 124 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  42.28 
 
 		 131 aa  79.3  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  39.47 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  38.4 
 
 		 130 aa  79  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  44.04 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  38.94 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 		 127 aa  77.4  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  42.99 
 
 		 116 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  48.42 
 
 		 125 aa  77  0.00000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  44.21 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  44.21 
 
 		 127 aa  77  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  41.67 
 
 		 127 aa  76.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  38.66 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  31.15 
 
 		 143 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  39.39 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 		 127 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  35.83 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  43.16 
 
 		 127 aa  75.1  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  42.74 
 
 		 133 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  41.12 
 
 		 134 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  39.25 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  39.25 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  37.82 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  43.96 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 140 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  41.76 
 
 		 127 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  38.32 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  38.32 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  38.32 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  38.32 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  38.32 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  36.13 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 162 aa  72.8  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  38.32 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  40.37 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 132 aa  71.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  40.54 
 
 		 121 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  36.11 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  40.37 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  38.21 
 
 		 142 aa  71.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  38.89 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  41.67 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  34.82 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  37.17 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0423  CrcB protein  32.14 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 		 125 aa  70.5  0.000000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1662  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  38.28 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  38.46 
 
 		 193 aa  70.1  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  36.79 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 		 129 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  38.6 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  37.5 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  46.15 
 
 		 130 aa  69.3  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  38.4 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  36.84 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  36.13 
 
 		 132 aa  69.3  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  35.59 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  37.5 
 
 		 125 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  38.32 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  37.6 
 
 		 132 aa  68.2  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  45.26 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  45 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  48.65 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  37.14 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  39.6 
 
 		 125 aa  67  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  42.45 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  36.19 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  35.85 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>