More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0395 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  100 
 
 
124 aa  233  6e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  55.46 
 
 
124 aa  117  7e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  58.7 
 
 
117 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  50 
 
 
123 aa  105  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  54.37 
 
 
120 aa  101  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  42.15 
 
 
122 aa  93.2  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3967  CrcB protein  54.55 
 
 
127 aa  92.4  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0131376  normal  0.336072 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  42.98 
 
 
122 aa  91.3  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2322  camphor resistance protein CrcB  54.9 
 
 
129 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  45.53 
 
 
134 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  39.13 
 
 
126 aa  87  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  39.13 
 
 
126 aa  87  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2698  CrcB protein  61.54 
 
 
119 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154728  hitchhiker  0.000362738 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  48.62 
 
 
123 aa  84.3  5e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  51.65 
 
 
114 aa  82.8  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  46.73 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  46.73 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  43.09 
 
 
126 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  44.54 
 
 
133 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  46.73 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  45.79 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  45.79 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  45.79 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  45.79 
 
 
124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  47.57 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  46.73 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  46.73 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  43.52 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 
122 aa  80.5  0.000000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  46.79 
 
 
140 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  43.8 
 
 
126 aa  79.7  0.00000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  43.56 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  43.56 
 
 
124 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
124 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  41.44 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  50 
 
 
118 aa  77.4  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  46.08 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  44.72 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  41.88 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
125 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  49 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
125 aa  75.9  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  47.37 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  48.42 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  43.22 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  42.72 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 
118 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  39.66 
 
 
119 aa  74.7  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4408  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  47.37 
 
 
126 aa  74.3  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  38.1 
 
 
143 aa  73.9  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1726  camphor resistance protein CrcB  47.52 
 
 
119 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390314  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1705  camphor resistance protein CrcB  47.52 
 
 
119 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.439733  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1773  camphor resistance protein CrcB  47.52 
 
 
119 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284335  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  43.97 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 
118 aa  73.6  0.0000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 
118 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  43.14 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  41.46 
 
 
124 aa  73.2  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  53.54 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  38.66 
 
 
122 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 
118 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 
118 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 
118 aa  72  0.000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  41.07 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13087  camphor resistance protein CrcB  48.21 
 
 
126 aa  72.8  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3757  normal  0.719495 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  43.01 
 
 
124 aa  72  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  38.21 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  44.68 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 
118 aa  72  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5013  CrcB protein  49.57 
 
 
116 aa  71.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 
118 aa  71.6  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  44.26 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  42.15 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  42.5 
 
 
126 aa  70.9  0.000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1662  camphor resistance protein CrcB  38.52 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111421  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 
124 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3466  CrcB protein  38.71 
 
 
162 aa  70.9  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  47.52 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  43.1 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  40.87 
 
 
128 aa  70.5  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  47.37 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  36.97 
 
 
122 aa  70.1  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  38.84 
 
 
121 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  42.48 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  42.48 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  34.68 
 
 
124 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  47.31 
 
 
107 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  47.92 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  42.57 
 
 
122 aa  68.6  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 
124 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  46.73 
 
 
118 aa  68.2  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  45.95 
 
 
123 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  49.51 
 
 
120 aa  67.8  0.00000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  41.74 
 
 
131 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4411  camphor resistance protein CrcB  45.05 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>