More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0192 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  100 
 
 		 120 aa  220  6e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  48.72 
 
 		 122 aa  107  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  50.98 
 
 		 124 aa  88.2  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3282  Camphor resistance CrcB protein  51.4 
 
 		 129 aa  85.1  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  48.65 
 
 		 123 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 119 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 		 118 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4408  camphor resistance protein CrcB  49.07 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  38.6 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0846  Integral membrane protein for chromosome condensation  39.82 
 
 		 121 aa  77.8  0.00000000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.523851  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  50.43 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  37.72 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 118 aa  75.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  38.6 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  38.6 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 118 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  43.97 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  43.52 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5442  CrcB protein  46.49 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.258176  normal  0.897038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  44.14 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  38.24 
 
 		 123 aa  70.1  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  42.72 
 
 		 120 aa  70.1  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  45 
 
 		 118 aa  69.7  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  43.75 
 
 		 117 aa  69.7  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  41.8 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  41.35 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1726  camphor resistance protein CrcB  46.46 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390314  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1705  camphor resistance protein CrcB  46.46 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.439733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  43.75 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1773  camphor resistance protein CrcB  46.46 
 
 		 119 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  41.28 
 
 		 132 aa  67.8  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  45.92 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  38.79 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  40.38 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  40.59 
 
 		 140 aa  67.4  0.00000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  44 
 
 		 116 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  41.51 
 
 		 140 aa  67  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0525  Camphor resistance CrcB protein  43.69 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2698  CrcB protein  53.19 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154728  hitchhiker  0.000362738 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 128 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  36 
 
 		 120 aa  66.2  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3962  CrcB protein  42.31 
 
 		 118 aa  65.5  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  36.04 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 131 aa  66.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  40.71 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  39.05 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  36.04 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  39.18 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  37.37 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  33.91 
 
 		 143 aa  63.9  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  42.59 
 
 		 126 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  40 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  39.05 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  39.05 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  39.05 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  37.04 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  37.27 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  36.84 
 
 		 127 aa  63.5  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  37.27 
 
 		 134 aa  63.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  36.79 
 
 		 128 aa  62.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  43.22 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  39.8 
 
 		 124 aa  63.5  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  40.38 
 
 		 127 aa  62  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  42.31 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  39.05 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0708  camphor resistance protein CrcB  42.7 
 
 		 133 aa  62.8  0.000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  39.13 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  35.96 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 124 aa  62  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  41.35 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2660  camphor resistance protein CrcB  40.17 
 
 		 122 aa  62  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28327  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0797  camphor resistance protein CrcB  42.22 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  36.13 
 
 		 127 aa  61.2  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 124 aa  61.2  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  40.95 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  35.16 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  31.3 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  36.52 
 
 		 128 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0372  CrcB protein  50 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  36.73 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3967  CrcB protein  45 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0131376  normal  0.336072 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  38.78 
 
 		 127 aa  60.5  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  32.29 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  43.24 
 
 		 127 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>