More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1020 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 128 aa  246  1e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  64.17 
 
 		 125 aa  145  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  64.17 
 
 		 125 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  54.55 
 
 		 134 aa  123  8.000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  54.55 
 
 		 126 aa  122  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  51.67 
 
 		 125 aa  116  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 124 aa  102  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  48.78 
 
 		 125 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  45.08 
 
 		 131 aa  98.2  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  46.67 
 
 		 124 aa  98.2  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  50.44 
 
 		 136 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  50.43 
 
 		 270 aa  95.9  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  47.37 
 
 		 121 aa  95.5  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  46.85 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  49.11 
 
 		 124 aa  95.1  3e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 		 129 aa  94.4  5e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  44.92 
 
 		 128 aa  93.6  8e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  46.67 
 
 		 130 aa  92.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  43.1 
 
 		 124 aa  92  2e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  51.64 
 
 		 124 aa  92  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  43.75 
 
 		 122 aa  92  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 128 aa  90.5  7e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  48.76 
 
 		 128 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  44.26 
 
 		 126 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  45.22 
 
 		 143 aa  89.4  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  49.53 
 
 		 125 aa  90.1  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  46.73 
 
 		 127 aa  88.6  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  48.31 
 
 		 122 aa  89.4  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  45.61 
 
 		 142 aa  88.6  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  46.09 
 
 		 126 aa  88.6  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  42.62 
 
 		 129 aa  87.8  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  39.68 
 
 		 130 aa  87  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  45.37 
 
 		 124 aa  85.5  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  35.58 
 
 		 134 aa  85.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  35.43 
 
 		 130 aa  85.1  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  42.98 
 
 		 133 aa  84.7  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 		 124 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  45.22 
 
 		 132 aa  84.7  4e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  45.28 
 
 		 130 aa  84.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 132 aa  84  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  45.26 
 
 		 126 aa  84.3  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  47.46 
 
 		 122 aa  84  7e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  45.76 
 
 		 129 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  40.98 
 
 		 140 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  38.98 
 
 		 118 aa  82.4  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  41.46 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 124 aa  82  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  42.73 
 
 		 122 aa  81.6  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  44.63 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  42.24 
 
 		 142 aa  81.6  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  44.21 
 
 		 126 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  48.98 
 
 		 113 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  44.76 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  44.76 
 
 		 125 aa  81.6  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  44.55 
 
 		 109 aa  80.9  0.000000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.390105 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 123 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  42.73 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  47.58 
 
 		 137 aa  80.5  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  48.08 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 162 aa  80.1  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  38.79 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  49.04 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  41.74 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  42.5 
 
 		 126 aa  80.1  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 131 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  42.62 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1434  camphor resistance protein CrcB  45.28 
 
 		 126 aa  79.7  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  36.8 
 
 		 124 aa  79  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  37.7 
 
 		 123 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 		 124 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0708  camphor resistance protein CrcB  45.74 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0797  camphor resistance protein CrcB  45.74 
 
 		 133 aa  78.2  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.682484  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  43.7 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 128 aa  77.4  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0817  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 133 aa  77  0.00000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0768  camphor resistance protein CrcB  45.61 
 
 		 144 aa  77  0.00000000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  44.17 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  35.65 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  44.21 
 
 		 228 aa  76.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0818  camphor resistance protein CrcB  45.61 
 
 		 137 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.682767  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  40.98 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  45.56 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  45.56 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  39.29 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  35.34 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  38.71 
 
 		 131 aa  76.6  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0767  camphor resistance protein CrcB  40.52 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  37.8 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  35.2 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>