More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1832 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 124 aa  239  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 		 124 aa  239  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  97.58 
 
 		 124 aa  236  9e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  81.3 
 
 		 124 aa  199  9e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  78.86 
 
 		 124 aa  192  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  78.86 
 
 		 124 aa  192  2e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  70.73 
 
 		 124 aa  175  2e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2385  camphor resistance protein CrcB  62.26 
 
 		 127 aa  137  7e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427512 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  45.13 
 
 		 132 aa  91.3  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  46.22 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  47.71 
 
 		 129 aa  86.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 		 128 aa  84.3  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 124 aa  84  6e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  46.34 
 
 		 126 aa  83.6  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3405  CrcB protein  80.7 
 
 		 66 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.356254 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  45.69 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  41.96 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 125 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  41.96 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  35.9 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  43.7 
 
 		 123 aa  77.8  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  38.79 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  37.07 
 
 		 140 aa  75.5  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 		 137 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  44.07 
 
 		 133 aa  71.6  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  40.35 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  29.82 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  40.32 
 
 		 131 aa  69.3  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 		 134 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 		 144 aa  69.7  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  40.32 
 
 		 126 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  31.93 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1374  camphor resistance protein CrcB  50.6 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2486  camphor resistance protein CrcB  50.6 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  38.71 
 
 		 126 aa  68.2  0.00000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  34.15 
 
 		 193 aa  67.4  0.00000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  38.71 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 128 aa  67  0.00000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  37.61 
 
 		 129 aa  67  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 162 aa  66.6  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  34.19 
 
 		 144 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  36.97 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0820  CrcB protein  36.36 
 
 		 134 aa  66.6  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000163322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  34.68 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  35.34 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  39.52 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  36.36 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  40.83 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  35.34 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  40 
 
 		 228 aa  64.3  0.0000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  35.48 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  35.48 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  42.05 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 		 144 aa  63.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  43.48 
 
 		 127 aa  63.2  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0732  camphor resistance protein CrcB  30.97 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.500903  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  37.19 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  41.28 
 
 		 124 aa  62  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  39.2 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0981  camphor resistance protein CrcB  47.67 
 
 		 123 aa  62  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 128 aa  62  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 132 aa  62.4  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  39.2 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  35.59 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  35.59 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  44.54 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  35.71 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  39.51 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  33.9 
 
 		 128 aa  62  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  32.48 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  32.48 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  39.47 
 
 		 124 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2393  Camphor resistance CrcB protein  43.69 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00142578 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2660  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28327  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  42.16 
 
 		 114 aa  60.8  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 130 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  47.37 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1949  camphor resistance protein CrcB  40.18 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  42.59 
 
 		 133 aa  59.7  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  39.78 
 
 		 128 aa  60.1  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2349  CrcB protein  33.33 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  38.71 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  45.45 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  33.91 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  32.52 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  26.61 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1326  crcB protein  41.94 
 
 		 129 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>