More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2689 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  100 
 
 		 142 aa  283  4e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2948  hypothetical protein  71.97 
 
 		 270 aa  192  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.448115  normal  0.663745 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  56.62 
 
 		 136 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  46.09 
 
 		 131 aa  117  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  48.09 
 
 		 132 aa  114  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  45.6 
 
 		 129 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  45.08 
 
 		 143 aa  106  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  46.4 
 
 		 138 aa  104  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3612  CrcB protein  43.44 
 
 		 142 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0121733  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0818  camphor resistance protein CrcB  45.04 
 
 		 137 aa  97.8  4e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.682767  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0768  camphor resistance protein CrcB  45.04 
 
 		 144 aa  97.8  4e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  45.61 
 
 		 128 aa  88.6  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  49.47 
 
 		 134 aa  87.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  49.47 
 
 		 126 aa  86.7  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  40.16 
 
 		 140 aa  86.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  41.82 
 
 		 132 aa  81.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  47.37 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 		 131 aa  77  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  44.66 
 
 		 125 aa  76.6  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  44.9 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  40.16 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  36.17 
 
 		 126 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0819  camphor resistance protein CrcB  44.79 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  41.32 
 
 		 121 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 		 129 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  42.86 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  36.59 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0817  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 		 133 aa  73.2  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2422  hypothetical protein  45.76 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.595974  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0767  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 130 aa  72.8  0.000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  39.02 
 
 		 124 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  46.88 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  34.96 
 
 		 130 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  34.71 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  34.68 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  40.68 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  33.33 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 		 134 aa  70.1  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  43.12 
 
 		 128 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  40.2 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1528  camphor resistance protein CrcB  43.96 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  40.2 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  38.4 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0201  camphor resistance CrcB protein  40.17 
 
 		 153 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.146005 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  43.96 
 
 		 132 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0802663 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  38.79 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1527  Camphor resistance CrcB protein  37.5 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  44.09 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  42.16 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  41.23 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  37.41 
 
 		 131 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  44.55 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 124 aa  67  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  39.25 
 
 		 125 aa  66.6  0.0000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  36.67 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 		 128 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  36.89 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  48.28 
 
 		 107 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  44.55 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  41.82 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  40 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  42.31 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  40.98 
 
 		 129 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 131 aa  65.1  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  34.65 
 
 		 128 aa  64.7  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  42.72 
 
 		 154 aa  64.3  0.0000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  45.56 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  38.95 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  36.52 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  44.44 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  36 
 
 		 126 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  41.53 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  31.2 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  40.38 
 
 		 131 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  30.17 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>