More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1649 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
125 aa  239  1e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  52.42 
 
 
125 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  52.5 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  51.64 
 
 
128 aa  111  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  50.81 
 
 
125 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  55.14 
 
 
124 aa  106  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  51.85 
 
 
127 aa  103  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  49.19 
 
 
126 aa  102  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  48.78 
 
 
128 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  45.53 
 
 
128 aa  100  8e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  46.72 
 
 
131 aa  100  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  45.9 
 
 
124 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  45.9 
 
 
125 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  52.1 
 
 
124 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  52.1 
 
 
124 aa  97.1  8e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  49.53 
 
 
125 aa  95.5  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  49.09 
 
 
113 aa  94.7  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  40.48 
 
 
130 aa  90.5  7e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3567  camphor resistance protein CrcB  47.54 
 
 
126 aa  90.1  8e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.366637  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  42.5 
 
 
134 aa  90.1  8e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  46.72 
 
 
137 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  41.8 
 
 
126 aa  89.7  1e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  49.18 
 
 
125 aa  89  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  46.61 
 
 
123 aa  87  8e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  48.65 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  48.78 
 
 
122 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3635  camphor resistance protein CrcB  48.94 
 
 
126 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3483  camphor resistance protein CrcB  47.87 
 
 
126 aa  83.6  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  43.55 
 
 
140 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  45.53 
 
 
122 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 
134 aa  81.6  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  37.82 
 
 
134 aa  81.3  0.000000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  40.98 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  41.46 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  44.72 
 
 
132 aa  80.5  0.000000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  37.1 
 
 
124 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  43.7 
 
 
128 aa  80.1  0.000000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  50.46 
 
 
107 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  49.21 
 
 
124 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  37.1 
 
 
124 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  45.24 
 
 
128 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 
126 aa  77.8  0.00000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  40.83 
 
 
124 aa  77  0.00000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 
124 aa  77  0.00000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  42.98 
 
 
124 aa  76.6  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  31.09 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  44.44 
 
 
133 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  41.8 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 
130 aa  76.6  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 
124 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  36.59 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0623  camphor resistance protein CrcB  49.48 
 
 
105 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  44.76 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  44.76 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  44.76 
 
 
124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  37.82 
 
 
118 aa  75.5  0.0000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  43.7 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  38.14 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  44.76 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 
124 aa  74.7  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  38.14 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  31.67 
 
 
126 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  33.87 
 
 
130 aa  73.6  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  31.67 
 
 
126 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  42.71 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  40.35 
 
 
127 aa  72.4  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  44.23 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  40.87 
 
 
143 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  41.49 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  42.15 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  36.96 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1662  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111421  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  32.2 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  39.5 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  40.34 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  40.16 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06970  hypothetical protein  43.33 
 
 
124 aa  69.7  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0290  camphor resistance protein CrcB  47.5 
 
 
154 aa  69.3  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.724729  normal  0.986535 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  38.21 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  37.9 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  37.19 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  36.29 
 
 
124 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  40.38 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  41.24 
 
 
129 aa  68.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  35.59 
 
 
151 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  35.85 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  35.85 
 
 
130 aa  68.2  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0708  camphor resistance protein CrcB  38.83 
 
 
133 aa  67.8  0.00000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.610565  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0520  CrcB protein  42.15 
 
 
118 aa  67.8  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0314  integral membrane protein  46.32 
 
 
109 aa  67.8  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.390105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>