More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3465 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  100 
 
 		 122 aa  237  5e-62  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  50.49 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  43.59 
 
 		 124 aa  95.5  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  42.15 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  48.54 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0525  Camphor resistance CrcB protein  47.9 
 
 		 120 aa  92.8  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.157849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  44.92 
 
 		 123 aa  92  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  46.28 
 
 		 126 aa  90.9  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4408  camphor resistance protein CrcB  45.54 
 
 		 122 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3962  CrcB protein  44.54 
 
 		 118 aa  89  2e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  44.44 
 
 		 134 aa  85.1  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  40.98 
 
 		 129 aa  84.3  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  49.48 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  42.73 
 
 		 128 aa  81.6  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4904  camphor resistance protein CrcB  42.35 
 
 		 118 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1726  camphor resistance protein CrcB  43.56 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390314  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1773  camphor resistance protein CrcB  43.56 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1705  camphor resistance protein CrcB  43.56 
 
 		 119 aa  81.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.439733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3282  Camphor resistance CrcB protein  44.23 
 
 		 129 aa  79.3  0.00000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3967  CrcB protein  51.11 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0131376  normal  0.336072 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4942  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0027  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0257719 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5320  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5221  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 118 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  41.8 
 
 		 122 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5217  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 118 aa  77.8  0.00000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 124 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13087  camphor resistance protein CrcB  42.37 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3757  normal  0.719495 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  39.05 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  40.7 
 
 		 120 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4547  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 132 aa  76.6  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.73644  normal  0.557218 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  40.52 
 
 		 133 aa  76.6  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4785  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 118 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0455  Camphor resistance CrcB protein  42.06 
 
 		 125 aa  75.9  0.0000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.592746  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2660  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28327  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  41.94 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  36.84 
 
 		 126 aa  75.1  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  36.84 
 
 		 126 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  44.79 
 
 		 107 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  38.52 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  38.37 
 
 		 119 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  36.75 
 
 		 131 aa  70.9  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 128 aa  70.9  0.000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  36.44 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  34.48 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2182  CrcB protein  38.94 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301494  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  36.97 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 131 aa  70.5  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  34.68 
 
 		 143 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0202  camphor resistance protein CrcB  40.91 
 
 		 132 aa  70.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0802663 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  33.61 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  37.4 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 140 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1528  camphor resistance protein CrcB  42.2 
 
 		 133 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  42.22 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  37.07 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  35.29 
 
 		 131 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2689  crcB protein  42.16 
 
 		 142 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0846  Integral membrane protein for chromosome condensation  35.4 
 
 		 121 aa  67.4  0.00000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.523851  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2708  hypothetical protein  40.52 
 
 		 119 aa  67  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  32.76 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 		 123 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4410  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 152 aa  66.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.811005 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0012  camphor resistance protein CrcB  41.28 
 
 		 129 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  30 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0817  camphor resistance protein CrcB  33.6 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  34.75 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  36.27 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  39.09 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  36.7 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  34.58 
 
 		 121 aa  65.1  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0767  camphor resistance protein CrcB  33.08 
 
 		 133 aa  65.1  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0243  Camphor resistance CrcB protein  44.33 
 
 		 123 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  31.71 
 
 		 130 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5873  CrcB protein  36.52 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00138039  normal  0.456433 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2698  CrcB protein  50.56 
 
 		 119 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154728  hitchhiker  0.000362738 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2040  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 129 aa  63.9  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.385836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  42.61 
 
 		 132 aa  63.9  0.0000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  37.74 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  33.91 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  33.61 
 
 		 128 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4411  camphor resistance protein CrcB  39.82 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0372  CrcB protein  43.96 
 
 		 120 aa  63.2  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 		 128 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>