More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3967 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3967  CrcB protein  100 
 
 		 127 aa  242  9.999999999999999e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0131376  normal  0.336072 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7364  CrcB protein  59.22 
 
 		 120 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  51.3 
 
 		 124 aa  113  6.9999999999999995e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1439  CrcB protein  50 
 
 		 123 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3465  CrcB protein  45.08 
 
 		 122 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  47.17 
 
 		 124 aa  97.1  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2955  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 117 aa  95.9  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.433823  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  40.65 
 
 		 140 aa  85.5  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  39.83 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13087  camphor resistance protein CrcB  46.43 
 
 		 126 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.3757  normal  0.719495 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4408  camphor resistance protein CrcB  40.87 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  33.63 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  33.63 
 
 		 126 aa  80.5  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  42.71 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0192  Camphor resistance CrcB protein  45.71 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0113998  normal  0.0611865 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2720  CrcB protein  37.96 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.177615 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  36.44 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1705  camphor resistance protein CrcB  48.31 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.439733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1726  camphor resistance protein CrcB  48.31 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.390314  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  38.46 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1773  camphor resistance protein CrcB  48.31 
 
 		 119 aa  75.5  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0284335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  37.14 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  37.14 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  37.14 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  37.14 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0455  Camphor resistance CrcB protein  41.9 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.592746  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2690  camphor resistance protein CrcB  37.4 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.190372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  38.98 
 
 		 137 aa  73.9  0.0000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  39.05 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 		 137 aa  73.6  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  36.19 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  36.19 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  36.19 
 
 		 124 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  36.19 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  41.58 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2060  CrcB protein  48.15 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000119505  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3650  camphor resistance protein CrcB  35.14 
 
 		 120 aa  72  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.842841  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4802  camphor resistance protein CrcB  38.84 
 
 		 137 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4903  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  35.25 
 
 		 126 aa  72  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  36.54 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  40 
 
 		 129 aa  72  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  42.2 
 
 		 131 aa  71.6  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  41.07 
 
 		 123 aa  71.6  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  35.64 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2563  CrcB protein  44.92 
 
 		 116 aa  71.2  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2322  camphor resistance protein CrcB  45.54 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.166352  normal  0.225427 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0815  CrcB protein  36.36 
 
 		 116 aa  70.9  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  34.17 
 
 		 132 aa  70.9  0.000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  37.5 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1553  CrcB protein  37.11 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  41.84 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  36.21 
 
 		 122 aa  70.5  0.000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 		 128 aa  70.5  0.000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 132 aa  70.1  0.000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  37.29 
 
 		 144 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  36.54 
 
 		 124 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 127 aa  70.1  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  41.44 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4941  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1310  CrcB protein  40 
 
 		 114 aa  69.7  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.307734  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5319  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 		 137 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4479  CrcB protein  37.38 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.29462  normal  0.278154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  36.21 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  37.14 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3962  CrcB protein  45.05 
 
 		 118 aa  68.9  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2648  CrcB protein  38.66 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0838344  normal  0.517536 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0903  CrcB protein  37.61 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  40.38 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  38.32 
 
 		 130 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  37.62 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2698  CrcB protein  44.33 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.154728  hitchhiker  0.000362738 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  39.42 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  35.19 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0925  CrcB protein  37.61 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  38.46 
 
 		 121 aa  67  0.00000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 124 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  33.98 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1481  camphor resistance CrcB protein  41.3 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3649  camphor resistance protein CrcB  35.14 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.602908  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  34.48 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2949  camphor resistance protein CrcB  39.32 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.478651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  35.14 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  33.05 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  37.7 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0975  camphor resistance protein CrcB  31.13 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00880668 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  37.38 
 
 		 130 aa  65.9  0.0000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  36.21 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>