More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0963 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
124 aa  230  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  80.65 
 
 
124 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  69.42 
 
 
122 aa  152  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  67.77 
 
 
122 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  59.32 
 
 
128 aa  130  6e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0838  camphor resistance CrcB protein  66.98 
 
 
107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127159  normal  0.560537 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  53.28 
 
 
124 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  54.62 
 
 
128 aa  122  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4768  CrcB protein  55.83 
 
 
131 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.260318  hitchhiker  0.000886617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1891  camphor resistance protein CrcB  55.93 
 
 
124 aa  117  3.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3620  camphor resistance protein CrcB  61.9 
 
 
124 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.382335  normal  0.669492 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  52.21 
 
 
130 aa  102  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  47.46 
 
 
126 aa  99.4  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  48.31 
 
 
134 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  48.78 
 
 
124 aa  95.1  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5305  camphor resistance protein CrcB  53.1 
 
 
113 aa  92.8  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.903783 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  56.07 
 
 
125 aa  92  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2766  CrcB protein  55.32 
 
 
127 aa  90.9  6e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.757747 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2101  crcB protein  48.78 
 
 
126 aa  90.1  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2836  camphor resistance protein CrcB  50.41 
 
 
132 aa  89.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0289291  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  48.65 
 
 
125 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1311  CrcB protein  60.58 
 
 
127 aa  83.6  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  44.55 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0789  CrcB protein  54.7 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.76348  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1657  camphor resistance protein CrcB  45.16 
 
 
128 aa  80.5  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0714688 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1744  camphor resistance protein CrcB  46.61 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.377174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0390  camphor resistance protein CrcB  46.61 
 
 
124 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  43.44 
 
 
125 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2493  camphor resistance protein CrcB  46.94 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00123017  normal  0.128362 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  43.44 
 
 
125 aa  80.1  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3600  camphor resistance protein CrcB  45.53 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0581659 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  44.17 
 
 
128 aa  77  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  38.89 
 
 
122 aa  77  0.00000000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  37.1 
 
 
127 aa  76.6  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  37.1 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  37.1 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1636  CrcB protein  40 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  43.12 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  42.72 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  45.79 
 
 
147 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  36.07 
 
 
125 aa  73.2  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1155  CrcB protein  42.48 
 
 
131 aa  73.2  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35352  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  40.16 
 
 
125 aa  72  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  44.76 
 
 
128 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2546  crcB protein  43.75 
 
 
131 aa  72  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.926417  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  43.12 
 
 
128 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  43.12 
 
 
128 aa  72  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  41.12 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  41.12 
 
 
128 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  42.11 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
130 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  35.77 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  46.81 
 
 
140 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  35.77 
 
 
126 aa  70.5  0.000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  40.19 
 
 
128 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  40.19 
 
 
128 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  40.19 
 
 
128 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  40.19 
 
 
128 aa  70.1  0.000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  39.39 
 
 
127 aa  70.1  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  39.42 
 
 
124 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2998  CrcB protein  41.23 
 
 
121 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  41.12 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  41.12 
 
 
137 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  42.15 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  44.66 
 
 
129 aa  69.3  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  37.04 
 
 
127 aa  69.3  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  37.96 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  39.42 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  38.05 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  47.13 
 
 
124 aa  67.8  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  39.67 
 
 
124 aa  67.4  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  39.36 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1433  CrcB protein  38.71 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.867471  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  43.33 
 
 
128 aa  66.6  0.00000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2709  camphor resistance protein CrcB  42.62 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  47.62 
 
 
122 aa  66.6  0.0000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  43.56 
 
 
123 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  37.5 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  38.46 
 
 
127 aa  65.5  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13500  crcB protein  37.61 
 
 
131 aa  65.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  41.84 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0591  CrcB protein  35.65 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000269  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1434  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 
126 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  44.35 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5187  camphor resistance protein CrcB  37.84 
 
 
118 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5236  camphor resistance protein CrcB  36.94 
 
 
118 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  46.24 
 
 
228 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0236  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
129 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.966722  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  44.66 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4673  CrcB protein  48.72 
 
 
128 aa  65.1  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.149388 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  39.36 
 
 
130 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  48.15 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  38.46 
 
 
127 aa  64.7  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  34.26 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  41.74 
 
 
193 aa  64.3  0.0000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  40.54 
 
 
124 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  43.62 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4803  camphor resistance protein CrcB  36.94 
 
 
118 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  41.07 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1662  camphor resistance protein CrcB  40.35 
 
 
124 aa  64.3  0.0000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.111421  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>