More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1711 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  100 
 
 		 126 aa  240  5e-63  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  46.4 
 
 		 125 aa  105  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  46.77 
 
 		 124 aa  104  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  49.54 
 
 		 124 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  48.28 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  46.55 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1029  CrcB protein  43.64 
 
 		 124 aa  88.6  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0154206  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1535  CrcB protein  44.26 
 
 		 124 aa  87.8  4e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.235581  normal  0.972453 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  43.12 
 
 		 133 aa  87.8  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  46.23 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  46.23 
 
 		 130 aa  85.9  2e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  45.87 
 
 		 130 aa  84  7e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  44.92 
 
 		 123 aa  84  7e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  40.65 
 
 		 124 aa  83.6  8e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 		 124 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  41.03 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  40.17 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  40.83 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  35.59 
 
 		 123 aa  80.5  0.000000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  39.84 
 
 		 134 aa  80.1  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2457  CrcB protein  42.37 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000828061  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  39.02 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  38.66 
 
 		 125 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  38.39 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 124 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 124 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1973  crcB protein domain-containing protein  46.32 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  39.34 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  42.57 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  38.71 
 
 		 122 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  37.5 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  38.52 
 
 		 128 aa  73.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  39.29 
 
 		 124 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  38.33 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  37.96 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  41.23 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 125 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  36.75 
 
 		 124 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  39.17 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  34.96 
 
 		 126 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1696  camphor resistance protein CrcB  39.13 
 
 		 99 aa  72  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.153881 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  34.96 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  34.96 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  41.67 
 
 		 124 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1914  CrcB protein  40.62 
 
 		 129 aa  71.2  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1988  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 126 aa  71.2  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227599  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  41.67 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0395  CrcB protein  42.5 
 
 		 124 aa  70.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.259615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  41.67 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0821  camphor resistance protein CrcB  38.05 
 
 		 119 aa  70.9  0.000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000515091  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  44.33 
 
 		 130 aa  70.5  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2756  camphor resistance protein CrcB  39.66 
 
 		 133 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0566  CrcB protein  36.97 
 
 		 151 aa  69.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.431956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 		 127 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  38.05 
 
 		 130 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1916  Camphor resistance CrcB protein  38.21 
 
 		 122 aa  69.7  0.00000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228129 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  42.11 
 
 		 140 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0304  CrcB protein  39.32 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.643284  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1023  camphor resistance protein CrcB  36.45 
 
 		 124 aa  68.9  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  35 
 
 		 128 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  38.71 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  38.71 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  38.71 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 128 aa  67.8  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  39.62 
 
 		 129 aa  68.2  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  45.26 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  40.82 
 
 		 126 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  35.54 
 
 		 128 aa  67.4  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2843  camphor resistance protein CrcB  42.99 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  39.42 
 
 		 130 aa  67  0.00000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  38.1 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  40.21 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  41.41 
 
 		 126 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  36.13 
 
 		 122 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2423  CrcB protein  40.2 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.541327  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  35.04 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  36.36 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  37.04 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  38.1 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  35.19 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>