More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2979 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  100 
 
 
133 aa  249  6e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1885  camphor resistance protein CrcB  57.14 
 
 
125 aa  90.1  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.230802  normal  0.0214416 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2087  camphor resistance protein CrcB  55.95 
 
 
125 aa  89.4  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0239295  normal  0.26829 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  43.12 
 
 
126 aa  87.8  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  43.41 
 
 
124 aa  87.4  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_002936  DET1498  camphor resistance protein CrcB  42.48 
 
 
130 aa  86.7  9e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0432518  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1288  camphor resistance protein CrcB  42.48 
 
 
130 aa  86.7  9e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0550  camphor resistance protein CrcB  45.54 
 
 
134 aa  86.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  41.09 
 
 
124 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  42.34 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0574  camphor resistance protein CrcB  45.54 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  42.34 
 
 
124 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  41.09 
 
 
132 aa  84.7  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1273  camphor resistance-like protein  41.59 
 
 
130 aa  84.3  5e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00180552  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  42.15 
 
 
124 aa  84.3  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  41.09 
 
 
124 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  41.09 
 
 
124 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  41.09 
 
 
124 aa  84.3  5e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2259  camphor resistance protein  42.62 
 
 
125 aa  84.3  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.913857  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  41.09 
 
 
124 aa  83.6  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  39.53 
 
 
124 aa  83.6  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  41.09 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  41.09 
 
 
124 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  46.79 
 
 
127 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  41.09 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  41.86 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  41.09 
 
 
124 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  42.45 
 
 
124 aa  82  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  49.43 
 
 
124 aa  82  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  43.4 
 
 
124 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3253  CrcB protein  40.5 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00499061  hitchhiker  0.0000000448266 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  40.16 
 
 
124 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1221  camphor resistance protein CrcB  40.98 
 
 
128 aa  80.1  0.000000000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0112093  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2768  CrcB protein  47.47 
 
 
133 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2102  camphor resistance protein CrcB  46.67 
 
 
124 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1460  CrcB protein  38.14 
 
 
126 aa  79  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1434  CrcB protein  38.14 
 
 
126 aa  78.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2599  camphor resistance protein CrcB  37.61 
 
 
126 aa  79.3  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  43.56 
 
 
128 aa  79  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2559  camphor resistance protein CrcB  37.88 
 
 
129 aa  79  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3649  camphor resistance protein CrcB  45.56 
 
 
162 aa  78.6  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.109393  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  43.86 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  43.86 
 
 
127 aa  78.2  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  40.5 
 
 
140 aa  77.8  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2396  CrcB protein  42.53 
 
 
124 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2285  camphor resistance CrcB protein  35.9 
 
 
125 aa  77  0.00000000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0188123  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
127 aa  77  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  42.74 
 
 
125 aa  76.3  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  46.9 
 
 
122 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  47.57 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.180087 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  42.15 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  42.15 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  42.15 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3981  CrcB protein  38.1 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000431472  normal  0.544134 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  42.15 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  34.48 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  42.15 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  42.15 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 
126 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  41.38 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  43.48 
 
 
154 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2541  Camphor resistance CrcB protein  44.14 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  48.94 
 
 
124 aa  75.1  0.0000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0200  camphor resistance protein CrcB  45 
 
 
128 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.299206  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  41.38 
 
 
127 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2926  crcB protein, putative  44.14 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 
127 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1649  camphor resistance protein CrcB  41.53 
 
 
125 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2398  camphor resistance protein CrcB  41.41 
 
 
130 aa  74.7  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  46.02 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  50.56 
 
 
128 aa  73.9  0.0000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.712483 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  41.32 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  41.32 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  41.32 
 
 
127 aa  73.6  0.0000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  38.58 
 
 
130 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 
128 aa  72.8  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 
126 aa  72  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2801  camphor resistance protein CrcB  47.47 
 
 
125 aa  72.8  0.000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  44.07 
 
 
124 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  38.79 
 
 
126 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  40.17 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  44.07 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  43.24 
 
 
124 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  46.32 
 
 
173 aa  71.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0885  CrcB protein  40.16 
 
 
138 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.780931 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  44.07 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1038  CrcB family protein  40.48 
 
 
124 aa  71.6  0.000000000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  44.35 
 
 
128 aa  71.2  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  41.3 
 
 
144 aa  70.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  44.55 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5186  camphor resistance protein CrcB  40.22 
 
 
144 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3454  hypothetical protein  51.69 
 
 
136 aa  70.1  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.767422  normal  0.0839513 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  40 
 
 
130 aa  70.1  0.000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2802  camphor resistance protein CrcB  38.28 
 
 
127 aa  70.1  0.000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.963327  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>