More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0486 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  100 
 
 		 130 aa  250  5.000000000000001e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  45.67 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0545  crcB protein  46.28 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0472858  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0624  hypothetical protein  45.45 
 
 		 122 aa  88.2  4e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0704  putative camphor resistance protein CrcB  46.03 
 
 		 122 aa  87.8  4e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  40.65 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  49.14 
 
 		 122 aa  84.3  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0524  camphor resistance protein CrcB  46.96 
 
 		 122 aa  82  0.000000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.184364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  49.14 
 
 		 122 aa  80.1  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3714  camphor resistance protein CrcB  44.55 
 
 		 132 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.805733 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0590  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1284  camphor resistance protein CrcB  38.89 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0693229  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  40.32 
 
 		 127 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  43.24 
 
 		 129 aa  73.2  0.000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  45.22 
 
 		 127 aa  72.8  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2480  camphor resistance protein CrcB  41.96 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000701119  hitchhiker  0.00000263281 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1258  camphor resistance protein CrcB  36.27 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.415853  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  37.01 
 
 		 123 aa  70.9  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3176  camphor resistance protein CrcB  33.61 
 
 		 124 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.709971  normal  0.0941711 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  37.4 
 
 		 127 aa  69.7  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3346  crcB family protein  33.61 
 
 		 124 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0956724  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3583  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0447685  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2130  camphor resistance protein CrcB  41.96 
 
 		 124 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000104865  normal  0.0132896 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1007  CrcB protein  36.51 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.83695  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2021  camphor resistance protein CrcB  43.3 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000176643  hitchhiker  0.000131067 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  36.59 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  42.31 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1746  camphor resistance protein CrcB  41.96 
 
 		 124 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00274275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 127 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1665  camphor resistance protein CrcB  43.56 
 
 		 128 aa  68.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0623118  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4001  camphor resistance protein CrcB  31.93 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.197793  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1832  camphor resistance protein CrcB  31.93 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.396081  hitchhiker  0.000454146 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  44.23 
 
 		 124 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1673  camphor resistance protein CrcB  42.55 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.180087 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  36.59 
 
 		 127 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2230  camphor resistance protein CrcB  42.55 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00947563  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  36.13 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3606  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898209 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  36.97 
 
 		 127 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 		 127 aa  67.4  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1873  CrcB protein  33.03 
 
 		 130 aa  67  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  41.9 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  41.9 
 
 		 124 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1711  CrcB protein  39.42 
 
 		 126 aa  67  0.00000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00823549  normal  0.187821 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2453  camphor resistance protein CrcB  40.71 
 
 		 126 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  40.95 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  40.95 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  40.95 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  42.86 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  41.9 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5216  camphor resistance protein CrcB  32.14 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  40.95 
 
 		 124 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  35.29 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  37.19 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  41.9 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0036  CrcB protein  38.94 
 
 		 134 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000868029  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00367  camphor resistance protein CrcB  38.14 
 
 		 127 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4407  camphor resistance protein CrcB  33.01 
 
 		 131 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1020  camphor resistance protein CrcB  34.17 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.712483 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  38.05 
 
 		 125 aa  65.1  0.0000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  43.3 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0028  camphor resistance protein CrcB  32.14 
 
 		 144 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0278741 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0524  camphor resistance protein CrcB  33.06 
 
 		 140 aa  65.1  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000767193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002071  CrbC-like protein  38.98 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0702  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0834947  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3016  camphor resistance protein CrcB  35.64 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.120468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0714  camphor resistance protein CrcB  33.33 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51179e-22 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2981  camphor resistance protein CrcB  36.28 
 
 		 126 aa  64.7  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0835  camphor resistance protein CrcB  34.65 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320485  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5235  camphor resistance protein CrcB  33.04 
 
 		 144 aa  64.3  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20960  CrcB protein  38.52 
 
 		 122 aa  64.7  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000428043  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02112  camphor resistance protein CrcB  36.7 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000584991  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28190  camphor resistance protein CrcB  32.77 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.152767  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3267  CrcB protein  34.75 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.954917  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0954  camphor resistance protein CrcB  35.56 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  38.39 
 
 		 133 aa  63.5  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0767  crcB protein  35.92 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0701738  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0503  camphor resistance protein CrcB  35.71 
 
 		 140 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5220  camphor resistance protein CrcB  32.52 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000234645  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5461  camphor resistance protein CrcB  35.85 
 
 		 124 aa  62.8  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.495223  normal  0.0525168 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0141  camphor resistance protein CrcB  36.54 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.726175  normal  0.558529 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2324  camphor resistance protein CrcB  36.27 
 
 		 173 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.618348  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2589  camphor resistance protein CrcB  43.53 
 
 		 132 aa  62.8  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0217  camphor resistance protein CrcB  36.27 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  30.7 
 
 		 129 aa  62.4  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4784  camphor resistance protein CrcB  31.25 
 
 		 137 aa  61.6  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  32.17 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  40.86 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0846  CrcB protein  37.74 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0135352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>