More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0477 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0477  CrcB protein  100 
 
 		 125 aa  239  7.999999999999999e-63  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.355934  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1520  camphor resistance protein CrcB  57.94 
 
 		 128 aa  132  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000607454  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3030  camphor resistance protein CrcB  57.94 
 
 		 128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3085  camphor resistance protein CrcB  57.94 
 
 		 128 aa  130  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2160  camphor resistance protein CrcB  57.14 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.105328  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0812  CrcB protein  57.6 
 
 		 129 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2583  camphor resistance protein CrcB  57.14 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2030  camphor resistance protein CrcB  57.14 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0749  camphor resistance protein CrcB  57.14 
 
 		 128 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0908  camphor resistance protein CrcB  56.91 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0467  camphor resistance protein CrcB  56.91 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0946  camphor resistance protein CrcB  56.91 
 
 		 128 aa  127  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.329935  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4047  camphor resistance protein CrcB  56.1 
 
 		 128 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2862  camphor resistance protein CrcB  53.6 
 
 		 127 aa  124  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  0.24707 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2451  camphor resistance protein CrcB  56.67 
 
 		 147 aa  124  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0795887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0816  camphor resistance protein CrcB  53.66 
 
 		 128 aa  123  7e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0805  camphor resistance protein CrcB  52.85 
 
 		 137 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1762  camphor resistance protein CrcB  50.83 
 
 		 126 aa  121  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1192  CrcB protein  54.39 
 
 		 127 aa  117  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1961  camphor resistance protein CrcB  53.27 
 
 		 126 aa  116  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000668068  normal  0.290782 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1559  camphor resistance protein CrcB  58.82 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1857  camphor resistance protein CrcB  50.43 
 
 		 127 aa  113  7.999999999999999e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0249161  normal  0.58099 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1600  camphor resistance protein CrcB  48.33 
 
 		 126 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.41093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2870  camphor resistance protein CrcB  48.33 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1606  camphor resistance protein CrcB  56.8 
 
 		 125 aa  112  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1516  camphor resistance protein CrcB  55.46 
 
 		 128 aa  112  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3030  camphor resistance protein CrcB  49.57 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0482718  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2957  camphor resistance protein CrcB  49.57 
 
 		 127 aa  111  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00612605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56980  camphor resistance protein CrcB  58.89 
 
 		 127 aa  110  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1269  camphor resistance protein CrcB  51.67 
 
 		 126 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.174734  normal  0.798877 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2340  camphor resistance protein CrcB  56.9 
 
 		 154 aa  109  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.613317 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4954  camphor resistance protein CrcB  60.23 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1333  camphor resistance protein CrcB  47.54 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164905  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1208  camphor resistance protein CrcB  51.67 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.115552  normal  0.0927816 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1160  camphor resistance protein CrcB  45.38 
 
 		 127 aa  108  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.478973 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3300  camphor resistance protein CrcB  55.08 
 
 		 126 aa  108  2.0000000000000002e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.266386  normal  0.647357 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0789  camphor resistance protein CrcB  45.38 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.136709  normal  0.909292 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0671  camphor resistance protein CrcB  45.38 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00156465  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0731  camphor resistance protein CrcB  45.38 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0685  camphor resistance protein CrcB  45.38 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0745  camphor resistance protein CrcB  45.38 
 
 		 127 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.311218  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3001  CrcB protein  45.38 
 
 		 127 aa  105  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0511618  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3020  camphor resistance protein CrcB  44.54 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00755665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1988  camphor resistance protein CrcB  50 
 
 		 126 aa  103  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.227599  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0539  camphor resistance protein CrcB  44.54 
 
 		 127 aa  103  6e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00594  camphor resistance protein CrcB  44.54 
 
 		 127 aa  103  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.243224  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00583  hypothetical protein  44.54 
 
 		 127 aa  103  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0649  camphor resistance protein CrcB  44.54 
 
 		 127 aa  103  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00715235  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0713  camphor resistance protein CrcB  44.54 
 
 		 127 aa  103  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000937309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0645  camphor resistance protein CrcB  44.54 
 
 		 127 aa  103  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0676  camphor resistance protein CrcB  44.54 
 
 		 127 aa  103  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462452  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1770  camphor resistance protein CrcB  52.1 
 
 		 128 aa  102  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565268  normal  0.101895 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3613  camphor resistance protein CrcB  44.8 
 
 		 126 aa  103  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000876303  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3446  camphor resistance protein CrcB  51.2 
 
 		 135 aa  101  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1562  crcB protein  51.43 
 
 		 128 aa  100  7e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1173  CrcB protein  46.55 
 
 		 127 aa  99.8  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000663248  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1036  camphor resistance protein CrcB  47.58 
 
 		 124 aa  98.6  2e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.222937  normal  0.100089 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3158  CrcB protein  47.41 
 
 		 127 aa  98.2  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000188116  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1125  CrcB protein  46.09 
 
 		 129 aa  97.4  6e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1084  CrcB protein  50.53 
 
 		 127 aa  95.5  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2589  camphor resistance protein CrcB  49.6 
 
 		 132 aa  95.5  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2486  camphor resistance protein CrcB  53.41 
 
 		 131 aa  94.7  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0836398 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1374  camphor resistance protein CrcB  53.41 
 
 		 131 aa  94.7  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2973  CrcB protein  45.45 
 
 		 127 aa  90.1  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0130018  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0776  camphor resistance protein CrcB  42.98 
 
 		 127 aa  84.7  4e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0583654  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1335  hypothetical protein  72.22 
 
 		 73 aa  80.1  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000608654 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2979  camphor resistance protein CrcB  42.74 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0963  camphor resistance protein CrcB  36.07 
 
 		 124 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1775  camphor resistance protein CrcB  40 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00911899  hitchhiker  0.00720449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3560  CrcB protein  41.12 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.511649  normal  0.0272637 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1548  camphor resistance protein CrcB  42.61 
 
 		 129 aa  70.5  0.000000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0761  CrcB protein  40 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.089216 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0364  CrcB protein  41.74 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000174023  hitchhiker  0.000495 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3430  camphor resistance protein CrcB  33.05 
 
 		 124 aa  68.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1422  CrcB protein  39.47 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1675  camphor resistance protein CrcB  37.7 
 
 		 124 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187669  normal  0.722038 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0812  camphor resistance protein CrcB  38.82 
 
 		 123 aa  67.4  0.00000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.00673919  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2473  CrcB protein  38.26 
 
 		 124 aa  66.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2008  camphor resistance protein CrcB  36.52 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00493999  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01045  putative Protein CrcB-like protein  40.51 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0985412  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2159  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0154034  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2309  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06121  putative Protein CrcB-like protein  40.51 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0202562  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0950  CrcB protein  36.22 
 
 		 128 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.238115  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0798  CrcB protein  37.61 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.24314  normal  0.169608 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2194  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 		 124 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000253648  normal  0.211581 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0486  camphor resistance CrcB protein  38.05 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0814  CrcB protein  38.79 
 
 		 129 aa  64.7  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1835  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1870  camphor resistance protein CrcB  38.02 
 
 		 147 aa  64.7  0.0000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1966  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000505957  normal  0.854467 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2010  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000369188  hitchhiker  0.000296247 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2053  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0174627  hitchhiker  0.00029045 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2320  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000583526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2212  camphor resistance protein CrcB  37.39 
 
 		 124 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000881037  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0586  CrcB protein  35.09 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.495788  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1395  camphor resistance protein CrcB  41.18 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.283613  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1798  camphor resistance protein CrcB  38.26 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00100672  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0313  camphor resistance protein CrcB  42.02 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1337  camphor resistance protein CrcB  34.51 
 
 		 128 aa  63.9  0.0000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.45948 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>